More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1434 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1434  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 
304 aa  603  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.89 
 
 
1190 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  78.29 
 
 
1398 aa  290  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  69.94 
 
 
1598 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  68.39 
 
 
1626 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  68.39 
 
 
1607 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  69.14 
 
 
1547 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  64.33 
 
 
1617 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  63.07 
 
 
1583 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  59.3 
 
 
1599 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  61.85 
 
 
1267 aa  219  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  58.48 
 
 
1609 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.38 
 
 
1684 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.24 
 
 
1623 aa  149  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1470  WD40 repeat, subgroup  56.07 
 
 
181 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.65 
 
 
1240 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.24 
 
 
1557 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  49.57 
 
 
1367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  48.25 
 
 
790 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  43.18 
 
 
1229 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  39.32 
 
 
1163 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  43.48 
 
 
1363 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  40 
 
 
1686 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  44.44 
 
 
1552 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  42.11 
 
 
1236 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  44 
 
 
1491 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.47 
 
 
947 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  40.35 
 
 
728 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  41.88 
 
 
1164 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40 
 
 
1652 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  41.18 
 
 
1661 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  43.65 
 
 
1100 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.52 
 
 
1004 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  45.22 
 
 
954 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  36.36 
 
 
1510 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  41.96 
 
 
1364 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  40.52 
 
 
1161 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  40.85 
 
 
696 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  41.53 
 
 
1190 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  41.32 
 
 
1416 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  40.52 
 
 
1161 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.43 
 
 
1481 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  39.84 
 
 
1656 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  43.48 
 
 
1214 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  39.32 
 
 
1599 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  46.15 
 
 
1714 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  40.35 
 
 
1553 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  41.98 
 
 
1523 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  41.03 
 
 
1789 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1271  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.5 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000038276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  43.33 
 
 
1357 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3475  serine/threonine protein kinase  87.27 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0338486  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  42.37 
 
 
1858 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.83 
 
 
1072 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  45.3 
 
 
1211 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.98 
 
 
676 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.83 
 
 
1076 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  40.18 
 
 
1280 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.24 
 
 
1072 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  39.67 
 
 
1242 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  42.24 
 
 
1188 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  40 
 
 
1878 aa  93.2  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.61 
 
 
1711 aa  92.8  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  39.5 
 
 
1193 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  35.71 
 
 
1262 aa  92.4  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.61 
 
 
740 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  40.98 
 
 
1209 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  39.39 
 
 
1766 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  39.61 
 
 
1344 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.83 
 
 
677 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  35.9 
 
 
1221 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  32.14 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  43.48 
 
 
840 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  35.29 
 
 
1188 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 
1196 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.81 
 
 
630 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  35.34 
 
 
657 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  39.67 
 
 
1217 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  37.07 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  36.97 
 
 
1474 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  40.18 
 
 
316 aa  87  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  38.89 
 
 
1247 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  38.33 
 
 
1807 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  37.72 
 
 
742 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  36.52 
 
 
826 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.69 
 
 
692 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.78 
 
 
1348 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  41.44 
 
 
577 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  42.48 
 
 
1176 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.1 
 
 
1760 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  34.06 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.06 
 
 
737 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  31.94 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.72 
 
 
682 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.94 
 
 
505 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  38.6 
 
 
1454 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  36.51 
 
 
652 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  32.43 
 
 
564 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.43 
 
 
930 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.93 
 
 
576 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>