179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1354 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1354  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 519 aa  1042    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0818  WD-40 repeat-containing protein  41.43 
 
 		 834 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.27 
 
 		 1523 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.54 
 
 		 1188 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1176 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.15 
 
 		 696 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30.22 
 
 		 728 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  35.21 
 
 		 1652 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  33.55 
 
 		 1868 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  31.21 
 
 		 1364 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.6 
 
 		 1454 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  25.66 
 
 		 928 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  34.81 
 
 		 947 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  32.26 
 
 		 772 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  32.26 
 
 		 772 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  25.89 
 
 		 618 aa  67  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.72 
 
 		 1711 aa  67  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  35.22 
 
 		 1177 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  35.59 
 
 		 1858 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1196 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1714 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.5 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 		 1789 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.82 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 826 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  28.12 
 
 		 678 aa  63.5  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 1760 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1190 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1214 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64825  SCF complex F-box protein MET30  26.38 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.138944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.59 
 
 		 1831 aa  60.1  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.09 
 
 		 1686 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.75 
 
 		 692 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1599 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  24.28 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 1221 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.06 
 
 		 1193 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.11 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.36 
 
 		 677 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  27.66 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  24.26 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1474 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 		 1878 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1304 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 		 1236 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  36.89 
 
 		 1280 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  30 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  23.3 
 
 		 523 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.37 
 
 		 1348 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 		 1163 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1661 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.72 
 
 		 1213 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 		 954 aa  54.7  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  26.25 
 
 		 520 aa  54.7  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 1209 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  29.92 
 
 		 782 aa  53.9  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.39 
 
 		 1330 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 1164 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1807 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  32.5 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.5 
 
 		 1247 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.57 
 
 		 930 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.53 
 
 		 589 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.67 
 
 		 1357 aa  52.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53294  Hypothetical WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 1117 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.149122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.23 
 
 		 596 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.91 
 
 		 1856 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3199  WD-40 repeat protein  31.88 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304748  normal  0.316415 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  30.57 
 
 		 813 aa  52  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.87 
 
 		 1363 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.06 
 
 		 682 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  31.54 
 
 		 1484 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.37 
 
 		 716 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  25.71 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.05 
 
 		 630 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.16 
 
 		 1547 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  26.55 
 
 		 840 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1553 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.66 
 
 		 1039 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.91 
 
 		 1901 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  31.73 
 
 		 778 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.48 
 
 		 774 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1427 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.99 
 
 		 733 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85406  predicted protein  26.22 
 
 		 780 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1209 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.16 
 
 		 742 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 		 1188 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0759  WD-40 repeat-containing protein  31.25 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  29.25 
 
 		 780 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  32.43 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  24.87 
 
 		 1279 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  21.47 
 
 		 495 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>