More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0818 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0818  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 834 aa  1639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1354  WD-40 repeat-containing protein  41.28 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  19.83 
 
 		 1454 aa  103  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  19.26 
 
 		 1523 aa  94  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.04 
 
 		 1789 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 		 696 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 		 1161 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.85 
 
 		 1868 aa  81.3  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 		 1161 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.14 
 
 		 1652 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.38 
 
 		 1711 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.95 
 
 		 1364 aa  79.3  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26 
 
 		 1221 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 		 1188 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.06 
 
 		 1213 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06217  F-box and WD repeat-containing protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12060)  22.3 
 
 		 618 aa  76.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.824291 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  27.31 
 
 		 928 aa  76.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 		 1760 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  30.16 
 
 		 947 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.14 
 
 		 1348 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.79 
 
 		 728 aa  74.7  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  34.92 
 
 		 774 aa  73.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1552 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1176 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.76 
 
 		 677 aa  73.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  19.8 
 
 		 565 aa  72.4  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1599 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  25.94 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 687 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  27.46 
 
 		 1280 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.87 
 
 		 1831 aa  71.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  27.44 
 
 		 1164 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  28.17 
 
 		 505 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1196 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.64 
 
 		 1823 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.42 
 
 		 1163 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.09 
 
 		 1193 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.77 
 
 		 589 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1190 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.26 
 
 		 1901 aa  68.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02050  sulfur metabolite repression control protein, putative  37.62 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 		 954 aa  68.2  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 		 826 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.96 
 
 		 1684 aa  67.8  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 1878 aa  67.4  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.95 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.4 
 
 		 943 aa  67  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.05 
 
 		 1807 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  29.19 
 
 		 374 aa  66.6  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1661 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06710  ubiquitin-protein ligase, putative  29.26 
 
 		 1012 aa  65.1  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.994255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.73 
 
 		 1686 aa  65.1  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  25.76 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1474 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1427 aa  65.1  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.39 
 
 		 692 aa  64.7  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.51 
 
 		 1217 aa  64.7  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24 
 
 		 1247 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  30.07 
 
 		 1177 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  20.92 
 
 		 1766 aa  64.3  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 		 1557 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.08 
 
 		 1363 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.51 
 
 		 1373 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 		 1209 aa  63.9  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1214 aa  63.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.32 
 
 		 1714 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.13 
 
 		 335 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 		 580 aa  63.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 		 317 aa  63.9  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02861  F-box and WD40 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11870)  34.21 
 
 		 656 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.714475 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0977  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 580 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  29.31 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  34.45 
 
 		 778 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  22.78 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.84 
 
 		 1236 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  24.27 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  33.09 
 
 		 1211 aa  62.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1209 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  22.49 
 
 		 1484 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  24.5 
 
 		 780 aa  62  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51367  predicted protein  34.51 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.149439  normal  0.0143416 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_42930  predicted protein  34.51 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.816964  normal  0.204876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  36.59 
 
 		 1416 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.86 
 
 		 1856 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28694  predicted protein  29.17 
 
 		 316 aa  62  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.08 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1041 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  33.82 
 
 		 578 aa  61.2  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  31.62 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  24.2 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.71 
 
 		 1626 aa  60.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05517  cell division control protein Cdc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13030)  45.45 
 
 		 1038 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  28.81 
 
 		 840 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  23.18 
 
 		 379 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0875  NapL  28.38 
 
 		 304 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.22 
 
 		 1190 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.46 
 
 		 443 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.01 
 
 		 842 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>