120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2314 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2314  aminotransferase class IV  100 
 
 		 257 aa  523  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2622  putative 4-amino-4-deoxychorismate lyase  60.16 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3619  hypothetical protein  38.91 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.8 
 
 		 741 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  31.58 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  30.96 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  23.95 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  29.02 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  29.13 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  29.17 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  24.24 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  25.69 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1273  putative branched-chain amino acid aminotransferase  24.24 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  27.04 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  28.63 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2271  branched-chain amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  25.77 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.63 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.34 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  27.76 
 
 		 310 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3082  hypothetical protein  30 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.1 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.24 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.17 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  37.04 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  31.16 
 
 		 553 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.48 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1302  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  24.64 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0291575  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0610  aminotransferase class IV  24.42 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0570431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  25.5 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.48 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  26.14 
 
 		 269 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.66 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  24.38 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  26.51 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.61 
 
 		 271 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  24.38 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  30.91 
 
 		 295 aa  49.3  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.33 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.81 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  35.24 
 
 		 320 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 303 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  30.33 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  25.67 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  30.33 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04770  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.48 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.19792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  24.9 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.75 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  27.86 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  28.7 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  24.24 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  27.24 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  24.15 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0049  hypothetical protein  27.83 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.732388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2509  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  24.15 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  24.15 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3756  aminotransferase class IV  27.39 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.64171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  27.01 
 
 		 596 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0576  aminotransferase, class IV  25 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00329112  normal  0.259763 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  31.19 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0662  aminotransferase class IV  25.71 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233198  normal  0.531418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  30.91 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1202  aminotransferase class IV  34.12 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  23.72 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  25.29 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.49 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  27.85 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  26.74 
 
 		 280 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  25.4 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  23.55 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  28.51 
 
 		 313 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  27.88 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  28.79 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  29.28 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1152  hypothetical protein  25.85 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3298  hypothetical protein  29.52 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.27 
 
 		 577 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.87 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.56 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  22.98 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3563  aminotransferase class IV  28.51 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  29.36 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.91 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2686  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.531081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1948  hypothetical protein  22.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0566548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3704  hypothetical protein  26.54 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  24.79 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  23.55 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  23.55 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  26.14 
 
 		 710 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25.13 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.79 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2260  aminotransferase class IV  25.84 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00278928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>