More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1131 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  557  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  55.89 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  58.37 
 
 		 263 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  44.49 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  47.2 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  44.19 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  43.03 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  38.52 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  40.6 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  46.33 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  43.33 
 
 		 280 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  38.33 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  35.98 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  39.23 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  45.64 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  34.23 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 299 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  32.27 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  32.12 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  36.25 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  36.98 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  32.48 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.39 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  35.68 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.11 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  36.61 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  36.61 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  34.71 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  40.32 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  40.32 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  36.75 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  34.09 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.08 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  37.36 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  33.83 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  34.72 
 
 		 293 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  35.37 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  40.57 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  35.1 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  32.85 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  32.83 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  33.83 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  40 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  33.61 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.82 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  41.15 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  36 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  35.8 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.43 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.37 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  36.78 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  35.2 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.4 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  45.74 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  35.83 
 
 		 278 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  34.03 
 
 		 347 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 271 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  35.47 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  36.43 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  35.78 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  32.69 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  37.69 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  39.15 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  29.77 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.04 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  36.19 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  34.12 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29691  aminotransferases class-IV  32.68 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  38.49 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.56 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>