More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1897 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  100 
 
 		 269 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.75 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  43.89 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  48.36 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  47.86 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  39.92 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  40.15 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  45.91 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  38.37 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  35.63 
 
 		 298 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  38.6 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  38.14 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  38.14 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  39.62 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  33.19 
 
 		 287 aa  140  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  42.97 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  35.5 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  33.89 
 
 		 281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  36.12 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  33.95 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  34.48 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  37.79 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.48 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  34.1 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  42.06 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.31 
 
 		 288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  42.39 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  37.45 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  33.59 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.77 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  38.7 
 
 		 270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.86 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  32.01 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  40.62 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  31.16 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.95 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  36.74 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  34.92 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  34.92 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  33.07 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 		 292 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  36.96 
 
 		 280 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  35.38 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  31.37 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  40.86 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  31.25 
 
 		 287 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  31.94 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  31.27 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.13 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1295  aminotransferase class-IV  30.31 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.326181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  32.44 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21671  aminotransferases class-IV  30.31 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.221172 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.52 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  32.7 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  35.09 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  32.55 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  35.43 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.87 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.02 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32.56 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 271 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  33.57 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  34.16 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.86 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  28.91 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  43.85 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.45 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18261  aminotransferase class-IV  29.34 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  33.33 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  36.69 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  32.28 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1220  aminotransferase class IV  29.96 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  31.76 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  35.52 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>