More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2096 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  100 
 
 
276 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  76.81 
 
 
276 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  67.52 
 
 
274 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  58.93 
 
 
280 aa  317  9e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  58.24 
 
 
278 aa  311  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  58.3 
 
 
280 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  58.11 
 
 
274 aa  276  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  50.88 
 
 
281 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  42.91 
 
 
292 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  45.96 
 
 
283 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  43.1 
 
 
287 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.87 
 
 
313 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  36.23 
 
 
299 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
299 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  34.64 
 
 
299 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  34.05 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
297 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 
293 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
277 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  35.89 
 
 
297 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.79 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  35.07 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.51 
 
 
288 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  34.48 
 
 
292 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 
292 aa  137  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  34.84 
 
 
295 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  34.38 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  34.54 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  32.29 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  32.99 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  33.1 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
291 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  34.29 
 
 
297 aa  132  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
347 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  33.92 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.96 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
298 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  33.22 
 
 
299 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 
298 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.64 
 
 
290 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  36.45 
 
 
307 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 
295 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  37.16 
 
 
261 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  31.14 
 
 
299 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.65 
 
 
290 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 
293 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  33.45 
 
 
276 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  31.43 
 
 
288 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  34.36 
 
 
284 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  35.03 
 
 
298 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  31.23 
 
 
299 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  33.33 
 
 
276 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  35.71 
 
 
307 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  35.37 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  35 
 
 
269 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 
287 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  33.84 
 
 
270 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
287 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  33.46 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  31.56 
 
 
282 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.36 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.28 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  29.29 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.04 
 
 
290 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.24 
 
 
290 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 
307 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  32.27 
 
 
271 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.1 
 
 
287 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.1 
 
 
281 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2240  aminotransferase class IV  29.73 
 
 
270 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  32.87 
 
 
302 aa  106  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.18 
 
 
290 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.47 
 
 
282 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  30.39 
 
 
303 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  35.46 
 
 
304 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  32.06 
 
 
294 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  29.93 
 
 
283 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.16 
 
 
290 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 
303 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  29.09 
 
 
291 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  32.35 
 
 
300 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>