More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2367 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 274 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  57.41 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  58.11 
 
 		 276 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  56.46 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  53.96 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  54.58 
 
 		 280 aa  258  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  54.58 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  52.88 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.45 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.62 
 
 		 313 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  48.71 
 
 		 283 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  47.55 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  43.3 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.73 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.26 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  32.85 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  31.1 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 		 290 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.69 
 
 		 292 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  33.92 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  32.37 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  38.02 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.49 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.71 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.9 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.94 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  31.29 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.6 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  32.84 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  32.04 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  26.5 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.83 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  34.49 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  33.09 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.47 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  30.71 
 
 		 293 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 299 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  31.67 
 
 		 297 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.64 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.26 
 
 		 292 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  32.1 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  34.59 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  34.47 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.06 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  35.49 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  31.93 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.9 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.9 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  30.8 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  33.78 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  36.04 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.05 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  34.48 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  31.38 
 
 		 292 aa  99  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.53 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.92 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  31.49 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  33.58 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  32.22 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  31.34 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.47 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  31.62 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  33.05 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2653  aminotransferase, class IV  30.11 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0838817  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  30.58 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>