More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2706 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  57.3 
 
 		 300 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  60.85 
 
 		 283 aa  322  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  61.37 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  55.52 
 
 		 286 aa  315  6e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.42 
 
 		 291 aa  311  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55 
 
 		 288 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.16 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  54.12 
 
 		 282 aa  286  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  50.71 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  46.15 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  47.12 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  47.99 
 
 		 321 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  50.35 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  50.7 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  50.7 
 
 		 308 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.99 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  50.7 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  50.7 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  47 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  50.53 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.16 
 
 		 303 aa  262  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.57 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.6 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.3 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  48.6 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  50 
 
 		 286 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.93 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  45.07 
 
 		 303 aa  255  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  47.1 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  44.14 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  49.08 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  47.48 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  47.67 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  43.38 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  46.95 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  43.8 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  43.8 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  43.38 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  42.31 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  48.9 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  43.91 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  45.26 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  45.85 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  46.35 
 
 		 301 aa  226  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  41.84 
 
 		 285 aa  225  8e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.05 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.05 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  41.34 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  38.38 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  43.68 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  37.41 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  38.32 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.52 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.64 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  42.24 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  47.79 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.53 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  42.19 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.17 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  41.34 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  39 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  43.12 
 
 		 286 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  40.54 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.32 
 
 		 284 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  42.18 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  40.58 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  42.2 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  41.82 
 
 		 286 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  42.45 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  39.77 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  41.16 
 
 		 284 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  39.85 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.57 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  39.7 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  39.57 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  38.46 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  40.57 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  37.6 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  40.79 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  40.78 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  42.18 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  38.63 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  39.86 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>