More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0536 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  63.6 
 
 
284 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  62.81 
 
 
286 aa  363  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  62.46 
 
 
286 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  62.46 
 
 
286 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  61.48 
 
 
284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.35 
 
 
286 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  63.03 
 
 
285 aa  344  8.999999999999999e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  60 
 
 
286 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.6 
 
 
285 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  57.24 
 
 
285 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  55.12 
 
 
285 aa  325  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  54.87 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  55.09 
 
 
288 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  54.15 
 
 
286 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  53.26 
 
 
286 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  53.38 
 
 
286 aa  295  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
293 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  53.05 
 
 
285 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  51.06 
 
 
293 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  53.93 
 
 
282 aa  290  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  51.06 
 
 
293 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  56.07 
 
 
282 aa  288  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
288 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  51.6 
 
 
286 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  50 
 
 
287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  52.73 
 
 
285 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  51.24 
 
 
285 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  51.24 
 
 
285 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  51.64 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  49.29 
 
 
290 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  49.29 
 
 
290 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 
286 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  46.04 
 
 
283 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  47.37 
 
 
287 aa  251  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
281 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  49.64 
 
 
283 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  42.86 
 
 
286 aa  246  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  41.91 
 
 
288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.43 
 
 
285 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
288 aa  236  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  48.72 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  47.83 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  46.38 
 
 
285 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  44.17 
 
 
288 aa  229  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  48.19 
 
 
285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.93 
 
 
285 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  47.83 
 
 
285 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  47.46 
 
 
285 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  38.21 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  48.2 
 
 
285 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  40.71 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  41.46 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  43.82 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  43.32 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  39.65 
 
 
287 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  40.94 
 
 
286 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  41.16 
 
 
285 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  42.45 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  38.65 
 
 
291 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  35.64 
 
 
282 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  35.64 
 
 
282 aa  187  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  37.91 
 
 
285 aa  185  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  39.57 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.97 
 
 
282 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  38.24 
 
 
286 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 
291 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  37.86 
 
 
294 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  36.16 
 
 
300 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 
282 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  35.53 
 
 
291 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  35.77 
 
 
291 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.84 
 
 
286 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  35.77 
 
 
291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  38.58 
 
 
282 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  35.77 
 
 
291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  36.97 
 
 
303 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.27 
 
 
291 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.96 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  34.8 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  34.94 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  36.47 
 
 
278 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  35.76 
 
 
304 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  36.84 
 
 
278 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.38 
 
 
295 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 
282 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.14 
 
 
300 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.92 
 
 
284 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.3 
 
 
288 aa  155  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  35.9 
 
 
286 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  32.4 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
290 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.62 
 
 
321 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  34.75 
 
 
290 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  32.13 
 
 
293 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>