More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3562 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  57.45 
 
 
293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  57.45 
 
 
293 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  57.45 
 
 
293 aa  335  7e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  61.96 
 
 
286 aa  330  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  55.84 
 
 
288 aa  329  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  57.4 
 
 
285 aa  318  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  59.85 
 
 
282 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  53.85 
 
 
283 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.88 
 
 
285 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  55.43 
 
 
285 aa  308  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  52.88 
 
 
285 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  50.18 
 
 
287 aa  305  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.91 
 
 
285 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  53.65 
 
 
285 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  53.65 
 
 
285 aa  298  6e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  51.29 
 
 
284 aa  296  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  52.92 
 
 
284 aa  295  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  49.64 
 
 
285 aa  295  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  49.09 
 
 
286 aa  291  7e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  48.73 
 
 
286 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  48.36 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  54.01 
 
 
290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  48.55 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  51.65 
 
 
290 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  51.65 
 
 
290 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  48.19 
 
 
286 aa  280  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  50 
 
 
286 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  56.57 
 
 
282 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  49.46 
 
 
286 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  47.46 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.28 
 
 
285 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  46.04 
 
 
284 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  47.81 
 
 
286 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  47.08 
 
 
286 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.08 
 
 
286 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.47 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  48.01 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  43.87 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  41.7 
 
 
303 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  46.91 
 
 
301 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  43.91 
 
 
286 aa  230  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  44.53 
 
 
286 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  45.04 
 
 
291 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  44.57 
 
 
281 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  43.12 
 
 
288 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  46.67 
 
 
285 aa  225  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  43.84 
 
 
285 aa  225  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  44.12 
 
 
285 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  43.64 
 
 
285 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  44.57 
 
 
285 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  40.96 
 
 
285 aa  218  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  42.28 
 
 
285 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  42.81 
 
 
287 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  44.81 
 
 
285 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  42.65 
 
 
285 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  40.58 
 
 
285 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  38.35 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  38.41 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  41.3 
 
 
286 aa  195  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
287 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  41.04 
 
 
282 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  41.04 
 
 
282 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  36.65 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  36.96 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  39.05 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.94 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  35.59 
 
 
291 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
291 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  35.59 
 
 
291 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  34.88 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  34.52 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  35.98 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
290 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.68 
 
 
282 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.17 
 
 
282 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.36 
 
 
295 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  35.4 
 
 
278 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  36.3 
 
 
290 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.93 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  34.67 
 
 
278 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 
290 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 
294 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 
294 aa  165  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.74 
 
 
290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  33.95 
 
 
291 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  36.92 
 
 
283 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 
291 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  33.7 
 
 
291 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.06 
 
 
288 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  32.36 
 
 
286 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  33.46 
 
 
300 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  33.88 
 
 
284 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  33.71 
 
 
288 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.96 
 
 
286 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>