More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0177 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  54.35 
 
 
283 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  55.16 
 
 
285 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  51.43 
 
 
300 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  53.74 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.72 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  50.35 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  44.77 
 
 
291 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  54.18 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.04 
 
 
288 aa  266  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  51.79 
 
 
294 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.81 
 
 
282 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  42.76 
 
 
285 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  44.01 
 
 
304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.42 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  46.4 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.76 
 
 
300 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  45.68 
 
 
285 aa  228  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  45.32 
 
 
285 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  42.76 
 
 
293 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  41.16 
 
 
285 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.41 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  42.18 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  43.55 
 
 
303 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.55 
 
 
303 aa  221  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  40.99 
 
 
303 aa  221  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  39.44 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  44.04 
 
 
285 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  44.14 
 
 
303 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  39.18 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  40.94 
 
 
297 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  39.55 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  43.49 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  43.82 
 
 
282 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  43.15 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.81 
 
 
308 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  39.71 
 
 
290 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  42.47 
 
 
308 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  42.47 
 
 
308 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  42.47 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  42.12 
 
 
308 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  38.11 
 
 
290 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  38.11 
 
 
290 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  41.28 
 
 
301 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  43.82 
 
 
282 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  36.92 
 
 
284 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  35.38 
 
 
286 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  40.5 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  39.43 
 
 
285 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  39.08 
 
 
285 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  41.37 
 
 
295 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  38.13 
 
 
288 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  37.72 
 
 
286 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.25 
 
 
286 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  38.25 
 
 
286 aa  185  9e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  38.43 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  34.43 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  35.23 
 
 
291 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
287 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  34.85 
 
 
291 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  39.79 
 
 
285 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  36.73 
 
 
288 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  34.85 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  39.36 
 
 
285 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
287 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  35.66 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  36.36 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  36.59 
 
 
293 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  34.47 
 
 
291 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  34.47 
 
 
291 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  38.79 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  33.82 
 
 
282 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  33.82 
 
 
282 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  38.38 
 
 
285 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  36.4 
 
 
286 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  34.09 
 
 
291 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  35.61 
 
 
287 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  34.39 
 
 
286 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  36.24 
 
 
287 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 
293 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
287 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 
293 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  33.71 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  39.3 
 
 
285 aa  175  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  37.54 
 
 
286 aa  175  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  38.73 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  32.97 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  35.36 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  35.58 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  38.25 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  31.16 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>