More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1210 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  58.01 
 
 
303 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  56.43 
 
 
288 aa  336  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.27 
 
 
288 aa  332  6e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  55.04 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  53.9 
 
 
286 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  50.72 
 
 
285 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  52.86 
 
 
282 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  49.48 
 
 
285 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  49.28 
 
 
285 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  49.13 
 
 
290 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  49.13 
 
 
290 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  48.08 
 
 
285 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  48.77 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  49.3 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
293 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  51.79 
 
 
282 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  49.12 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  47.29 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  48.07 
 
 
286 aa  271  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  50.54 
 
 
288 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  46.93 
 
 
286 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  45.32 
 
 
285 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.32 
 
 
285 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.67 
 
 
285 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  47.46 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  50.89 
 
 
286 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  48.42 
 
 
286 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.24 
 
 
285 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  43.53 
 
 
285 aa  260  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  45.23 
 
 
284 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  44.8 
 
 
286 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.37 
 
 
286 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  47.37 
 
 
286 aa  257  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  44.44 
 
 
286 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  43.77 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  46.62 
 
 
288 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  44.48 
 
 
287 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  42.86 
 
 
284 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  42.96 
 
 
286 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  41.9 
 
 
288 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  42.65 
 
 
291 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  40.5 
 
 
283 aa  221  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  41.49 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  41.82 
 
 
285 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  40.65 
 
 
285 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  38.52 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  40.93 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  40 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  40 
 
 
281 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  39.57 
 
 
285 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  38.6 
 
 
283 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  40.57 
 
 
285 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.93 
 
 
282 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  38.33 
 
 
287 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  38.29 
 
 
300 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  38.73 
 
 
286 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37.98 
 
 
287 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
285 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  38.21 
 
 
293 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  38.79 
 
 
304 aa  203  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  40.36 
 
 
285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  41.22 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  41.22 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  39.21 
 
 
285 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  38.93 
 
 
321 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  37.64 
 
 
286 aa  198  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  36.43 
 
 
301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.63 
 
 
287 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36.88 
 
 
297 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
285 aa  192  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.38 
 
 
286 aa  192  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.96 
 
 
288 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.77 
 
 
282 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.26 
 
 
321 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  39.78 
 
 
282 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.32 
 
 
303 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  39.58 
 
 
291 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  40.36 
 
 
288 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.28 
 
 
300 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37 
 
 
291 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.38 
 
 
291 aa  185  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  38.57 
 
 
291 aa  185  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  38.3 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  38.57 
 
 
291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
291 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
291 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  39.38 
 
 
308 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  38.72 
 
 
290 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  39.34 
 
 
282 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  39.26 
 
 
291 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  38.21 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.84 
 
 
295 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
290 aa  178  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  35.17 
 
 
303 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  37.33 
 
 
315 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>