More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3455 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  99.3 
 
 		 285 aa  566  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  83.86 
 
 		 285 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  61.67 
 
 		 286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  59.93 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  57.54 
 
 		 284 aa  344  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  57.84 
 
 		 286 aa  338  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  57.89 
 
 		 284 aa  337  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  58.54 
 
 		 286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  57.6 
 
 		 284 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  58.54 
 
 		 286 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  57.91 
 
 		 286 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.49 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  56.63 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  55.63 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  56.69 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  58.42 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  53.68 
 
 		 288 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 288 aa  311  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  52.88 
 
 		 283 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  52.33 
 
 		 286 aa  308  8e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  52.69 
 
 		 286 aa  308  9e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  55.76 
 
 		 282 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  55.96 
 
 		 285 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  51.93 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  51.93 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  51.23 
 
 		 293 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  56.58 
 
 		 286 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  54.87 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  54.15 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  55.76 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  52.71 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  52.52 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  52.52 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.76 
 
 		 285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  45.32 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  48.78 
 
 		 287 aa  261  8e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  49.64 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  48.2 
 
 		 286 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  49.09 
 
 		 285 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 		 285 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  48.56 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  43.59 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  41.79 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  49.45 
 
 		 285 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  44.21 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  49.09 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  45.85 
 
 		 301 aa  235  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  46.4 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  44.25 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  48 
 
 		 285 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  43.01 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  45.82 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  45.52 
 
 		 291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  46.91 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  45.2 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  41.87 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  38.55 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  43.17 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  36.56 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  36.56 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.73 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  39.21 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  39.71 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  38.85 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.97 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.46 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.54 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  38.85 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.71 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  35.04 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  37.94 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  34.88 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  37.76 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.1 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 321 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  38.79 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  34.59 
 
 		 290 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.25 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  34.09 
 
 		 306 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  32.85 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.66 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  34.63 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  35.49 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  32.48 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  32.2 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  32.34 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  36.13 
 
 		 291 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  32.95 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  32.34 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  32.34 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>