More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1546 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 304 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  83.28 
 
 		 293 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  71.81 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  71.86 
 
 		 300 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  63.95 
 
 		 297 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  58.62 
 
 		 303 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  56.38 
 
 		 282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  56.74 
 
 		 282 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  49.16 
 
 		 303 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  50.33 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.07 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.88 
 
 		 308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  51.24 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  49.48 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  46.05 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  47.87 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  49.47 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  49.12 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  49.47 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  49.47 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  49.12 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  46.15 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.61 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  44.56 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  46.15 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  43.84 
 
 		 283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.51 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  43.45 
 
 		 294 aa  238  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.01 
 
 		 286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  42.21 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  39.93 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  40.35 
 
 		 285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  40 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  38.25 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.79 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  41.92 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  36.65 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  36.65 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.46 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  35.59 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  37.98 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  37.19 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  36.92 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  36.92 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  36.92 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  39.45 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.79 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  36.33 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  35.99 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  36.46 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  33.93 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  38.01 
 
 		 286 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  39.78 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  37.11 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  38.49 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  36.01 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  35.37 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  36.4 
 
 		 286 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  34.74 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  36.43 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  35.64 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  32.74 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  33.45 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  38.13 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  34.52 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  38.57 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  36.3 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  32.96 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  37.37 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.94 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  35.94 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  31.46 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  32.26 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  34.53 
 
 		 285 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 293 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 293 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  34.15 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  34.63 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  34.83 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  31.84 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  31.84 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.71 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  34.81 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  34.26 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>