More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2225 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  81.56 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  62.33 
 
 		 321 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  60.27 
 
 		 321 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  59.66 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  58.62 
 
 		 308 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  59.45 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  59.11 
 
 		 315 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  58.97 
 
 		 308 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  58.62 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  58.62 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  58.28 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  57.59 
 
 		 308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  58.33 
 
 		 297 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  56.74 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  54.45 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.8 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  55.52 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.08 
 
 		 303 aa  295  7e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  49.82 
 
 		 286 aa  280  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.09 
 
 		 288 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  47.2 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  46.93 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  47.08 
 
 		 282 aa  244  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  44.93 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  48.69 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  45.77 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.2 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.42 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  45 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.71 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.71 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  44.13 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  44.57 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  43.12 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  44.2 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  42.65 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  38.24 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  40.14 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.87 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  36.86 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  37.59 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.25 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.77 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  40.71 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  39.47 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  41.42 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  38.43 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  38.99 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  39.56 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  39.13 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.67 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  36.88 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.72 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.72 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  38.41 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  38.55 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  41.39 
 
 		 282 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  39.13 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  36.5 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  37.63 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.38 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  39.05 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.45 
 
 		 287 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  38.77 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  35.19 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37.82 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  34.78 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  39.29 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  38.41 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  34.06 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  34.06 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  34.06 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.69 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  35.9 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  36.82 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.98 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  35.46 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  33.93 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  34.04 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  33.82 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  36.23 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  34.83 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  34.07 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  34.46 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>