More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2359 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 
285 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
293 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  57.95 
 
 
293 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  57.14 
 
 
288 aa  323  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  56.63 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  54.91 
 
 
283 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  54.84 
 
 
290 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  54.84 
 
 
290 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  54.8 
 
 
285 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  54.64 
 
 
282 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.76 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  51.76 
 
 
285 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  56.23 
 
 
286 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  50.35 
 
 
287 aa  279  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  51.94 
 
 
285 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  52.5 
 
 
285 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  52.31 
 
 
284 aa  277  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  49.82 
 
 
285 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  51.59 
 
 
285 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  51.81 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  49.3 
 
 
286 aa  269  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  47.67 
 
 
286 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  48.76 
 
 
288 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  53.21 
 
 
282 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  49.65 
 
 
286 aa  265  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  48.59 
 
 
286 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  49.65 
 
 
286 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.28 
 
 
286 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  49.28 
 
 
286 aa  261  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.12 
 
 
285 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  49.3 
 
 
286 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  49.1 
 
 
283 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  47.89 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  46.1 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  46.1 
 
 
286 aa  253  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.39 
 
 
288 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  44.93 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  44.69 
 
 
288 aa  243  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  46.43 
 
 
284 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.77 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  45.55 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  46.02 
 
 
288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  46.93 
 
 
281 aa  232  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  46.1 
 
 
287 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  41.16 
 
 
303 aa  229  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  44.84 
 
 
285 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  43.32 
 
 
286 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  44.84 
 
 
285 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  44.17 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  46.1 
 
 
285 aa  219  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  47.16 
 
 
285 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  46.26 
 
 
285 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  45.55 
 
 
285 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  43.38 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  42.65 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  45.85 
 
 
286 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  40.75 
 
 
287 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
287 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  39.37 
 
 
287 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  37.55 
 
 
285 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37.32 
 
 
282 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37.32 
 
 
282 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  32.97 
 
 
291 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.76 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  37.1 
 
 
295 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 
282 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  39.21 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  37.59 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  36.59 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.37 
 
 
283 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
291 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.97 
 
 
306 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  37 
 
 
291 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
291 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
291 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  37.77 
 
 
291 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  37.77 
 
 
291 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  37.77 
 
 
291 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.41 
 
 
291 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  38.46 
 
 
290 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  38.13 
 
 
291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  38.11 
 
 
290 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  34.51 
 
 
299 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.52 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  37.41 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  37.21 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  36.84 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>