More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1631 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  95.47 
 
 
287 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  78.75 
 
 
287 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  66.2 
 
 
288 aa  407  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  60.78 
 
 
285 aa  349  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  57.19 
 
 
285 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  58.16 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  57.91 
 
 
285 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  56.74 
 
 
285 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  52.65 
 
 
285 aa  316  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  56.47 
 
 
281 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  54.7 
 
 
287 aa  315  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  55.4 
 
 
286 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  55.4 
 
 
285 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  53.96 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  51.76 
 
 
286 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  52.14 
 
 
301 aa  275  8e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  52.26 
 
 
291 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  44.56 
 
 
285 aa  238  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  44.72 
 
 
285 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  45.58 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  45.58 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  44.25 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.25 
 
 
285 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  43.86 
 
 
285 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  43.31 
 
 
282 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  41.81 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  43.51 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  42.86 
 
 
284 aa  228  8e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  40.91 
 
 
288 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  43.82 
 
 
290 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
293 aa  224  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
293 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  41.81 
 
 
284 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  43.31 
 
 
282 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.52 
 
 
286 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  41.52 
 
 
286 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  39.58 
 
 
286 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  41.87 
 
 
286 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  41.34 
 
 
285 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.71 
 
 
285 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  40.28 
 
 
286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  37.54 
 
 
286 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  39.93 
 
 
285 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  41.46 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  37.54 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  45.02 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  39.58 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  40.86 
 
 
286 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  38.38 
 
 
287 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  40.5 
 
 
286 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.33 
 
 
286 aa  205  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  37.76 
 
 
288 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 
285 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  38.35 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.83 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  40.5 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  36.26 
 
 
288 aa  188  8e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  35.92 
 
 
303 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  38.15 
 
 
300 aa  186  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.75 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  36.82 
 
 
291 aa  183  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.93 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.55 
 
 
282 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 
286 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  38.31 
 
 
290 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.36 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
288 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
290 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.07 
 
 
284 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
306 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.8 
 
 
282 aa  177  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  34.71 
 
 
293 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  37.83 
 
 
287 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  34.43 
 
 
282 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  37.94 
 
 
285 aa  175  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  34.43 
 
 
282 aa  175  9e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  36.12 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  34.74 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  35.27 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  36.26 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  35.47 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.68 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  37.32 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
291 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.46 
 
 
300 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.1 
 
 
283 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.28 
 
 
291 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.92 
 
 
303 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  35.4 
 
 
291 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  34.48 
 
 
294 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  34.48 
 
 
290 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  34.48 
 
 
294 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.51 
 
 
291 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 
291 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 
291 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>