More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1294 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  100 
 
 
286 aa  591  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  83.92 
 
 
287 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  71.33 
 
 
286 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  71.33 
 
 
286 aa  437  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  68.77 
 
 
286 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  67.02 
 
 
286 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  57.5 
 
 
286 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  56.79 
 
 
286 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  56.07 
 
 
286 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  56.07 
 
 
286 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  56.07 
 
 
286 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.63 
 
 
285 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  55.28 
 
 
285 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  54.42 
 
 
285 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  55.56 
 
 
284 aa  314  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.86 
 
 
285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  53.05 
 
 
284 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  52.3 
 
 
282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  53.55 
 
 
288 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
293 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
293 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  48.94 
 
 
285 aa  294  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  47.86 
 
 
285 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  49.11 
 
 
293 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  50.53 
 
 
286 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  47.16 
 
 
285 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  51.6 
 
 
284 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  48.36 
 
 
283 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  46.81 
 
 
285 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  50.18 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  50.36 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  47.72 
 
 
290 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  46.29 
 
 
290 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  46.29 
 
 
290 aa  275  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 
285 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.22 
 
 
288 aa  263  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  43.17 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  43.22 
 
 
288 aa  256  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  43.77 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  47.69 
 
 
283 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  45.04 
 
 
285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  42.96 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
285 aa  241  9e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  46.74 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  46.26 
 
 
281 aa  235  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  42.86 
 
 
286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  44.8 
 
 
285 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  45.61 
 
 
301 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  46.57 
 
 
285 aa  230  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  45.94 
 
 
285 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  41.52 
 
 
286 aa  229  5e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  43.51 
 
 
287 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  43.62 
 
 
291 aa  224  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  45.2 
 
 
285 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
285 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  42.76 
 
 
285 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  40.7 
 
 
286 aa  219  6e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  39.58 
 
 
287 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 
287 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
287 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  42.18 
 
 
285 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  36.26 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  36.26 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  36.4 
 
 
282 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  40.51 
 
 
283 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.92 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  39.78 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  36.69 
 
 
291 aa  181  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  38.2 
 
 
290 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.83 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  38.46 
 
 
300 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.4 
 
 
286 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  34.64 
 
 
278 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  35.36 
 
 
278 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  37.92 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  37.92 
 
 
291 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  38.55 
 
 
290 aa  175  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
291 aa  175  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.33 
 
 
288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  37.17 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  37.64 
 
 
291 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
290 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  36.93 
 
 
303 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  36.43 
 
 
291 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
294 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
294 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  37.12 
 
 
290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  34.3 
 
 
285 aa  168  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  33.1 
 
 
299 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
288 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  34.04 
 
 
299 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  36.74 
 
 
290 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  36.74 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  36.74 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.75 
 
 
299 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>