More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1682 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  100 
 
 		 291 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  56.25 
 
 		 288 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  54.2 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  54.32 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  52.45 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  53.93 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  53.6 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  54.42 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  54.04 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  55.87 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  52.28 
 
 		 287 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  49.64 
 
 		 287 aa  281  9e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  54.8 
 
 		 285 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  55.52 
 
 		 285 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  53.38 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  53.74 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  53.38 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  51.79 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  47.86 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  47.86 
 
 		 290 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  48.07 
 
 		 285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  49.12 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  48.04 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  48.76 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  46.24 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  46.04 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.41 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  48.41 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  45.36 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  47.35 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.52 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  45.52 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  44.83 
 
 		 286 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  46.93 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.69 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  43.62 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  43.36 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  42.86 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  47.16 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  45.04 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  45.71 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  43.16 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  43.51 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  41.55 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  43.51 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  42.65 
 
 		 286 aa  235  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  45.16 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  45.16 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.17 
 
 		 285 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  40.96 
 
 		 288 aa  225  8e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  47.33 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  42.03 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  43.46 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  38.89 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  42.45 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  37.09 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  42.65 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  41.03 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  38.32 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  39.86 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  38.85 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  39.58 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  38.99 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  38.95 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  38.95 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  41.15 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  39.27 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.59 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  40.08 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.84 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  39.69 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.05 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.01 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  36.11 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  40.08 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  36.53 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  35.88 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.15 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.69 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  35.4 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  37.45 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.69 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  39.23 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  38.46 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  35.59 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  36.6 
 
 		 278 aa  169  7e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.23 
 
 		 288 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  33.21 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  38.35 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  35.85 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  36.76 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.05 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>