More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0960 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  100 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  98.95 
 
 
285 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  94.39 
 
 
285 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  74.18 
 
 
285 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  68.93 
 
 
282 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  62.14 
 
 
290 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  68.57 
 
 
282 aa  350  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  61.43 
 
 
290 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  61.43 
 
 
290 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  62.63 
 
 
286 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  55.91 
 
 
286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  53.43 
 
 
284 aa  301  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
293 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
293 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.84 
 
 
286 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  53.65 
 
 
283 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  54.84 
 
 
286 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  54.12 
 
 
286 aa  298  9e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  51.79 
 
 
286 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 
285 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  52.98 
 
 
286 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  52.3 
 
 
293 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  50.35 
 
 
286 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  54.51 
 
 
285 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  48.23 
 
 
287 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  49.48 
 
 
286 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  53.38 
 
 
288 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  51.99 
 
 
285 aa  288  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  47.16 
 
 
286 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  47.37 
 
 
286 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  52.88 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  48.72 
 
 
288 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.44 
 
 
285 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  47.12 
 
 
286 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.94 
 
 
285 aa  278  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
288 aa  275  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  51.24 
 
 
284 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  48.34 
 
 
303 aa  275  8e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  48.76 
 
 
288 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  47.37 
 
 
288 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  47.6 
 
 
286 aa  256  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  45.39 
 
 
285 aa  255  7e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  49.29 
 
 
301 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  49.12 
 
 
285 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  48.77 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  47.67 
 
 
285 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 
285 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  47.65 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  47.02 
 
 
285 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
291 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  50.35 
 
 
285 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.94 
 
 
288 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  45.49 
 
 
283 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  48.58 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  45.14 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  43.86 
 
 
287 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.4 
 
 
286 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  43.16 
 
 
287 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.91 
 
 
285 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  45.88 
 
 
287 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.31 
 
 
282 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  42.91 
 
 
287 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  49.28 
 
 
283 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  43.86 
 
 
286 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
285 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  40.65 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  41.94 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  40.35 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.57 
 
 
282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.33 
 
 
321 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  42.55 
 
 
294 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  44.2 
 
 
282 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.86 
 
 
282 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.86 
 
 
282 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  43.71 
 
 
321 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.36 
 
 
291 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  38.41 
 
 
291 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  40 
 
 
293 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  42.25 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  44.68 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.21 
 
 
300 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  43.97 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  41.82 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  40.49 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  38.25 
 
 
285 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  41.9 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  44.73 
 
 
308 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.6 
 
 
308 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  44.24 
 
 
308 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  43.88 
 
 
308 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  44.6 
 
 
308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  44.6 
 
 
308 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  39.48 
 
 
282 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  44.24 
 
 
308 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>