More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0106 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  100 
 
 		 283 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  60.85 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  54.61 
 
 		 300 aa  314  8e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.48 
 
 		 288 aa  298  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.35 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.67 
 
 		 291 aa  294  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  51.58 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  54.84 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  44.6 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  53.02 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  50.54 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.58 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  43.84 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  46.01 
 
 		 297 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  43.73 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.01 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.77 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  42.61 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  42.2 
 
 		 285 aa  236  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.32 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  41.34 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  43.58 
 
 		 321 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.57 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  43.75 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  49.28 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  45.02 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  48.92 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  45.24 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  46.1 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  45.76 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  41.9 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.56 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  48.73 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  44.22 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  44.22 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  39.78 
 
 		 278 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  44.22 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  39.05 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  43.16 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.6 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  42.41 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  40 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  40.49 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  41.03 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  43.07 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  37.04 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  39.19 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  35.93 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  38.77 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  39.93 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.93 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  34.88 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.68 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.68 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  36.74 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  36 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  38.03 
 
 		 287 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  36 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  36.4 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  40.51 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 288 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  39.36 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  36.33 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  36.72 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  40.71 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  36.43 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  38.1 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  40.08 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  39.57 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  38.71 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 286 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  35.27 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  35.27 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.14 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  38.71 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  38.24 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  33.7 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.71 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>