More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4521 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  100 
 
 		 290 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  87.93 
 
 		 290 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  68.44 
 
 		 282 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  62.5 
 
 		 285 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  64.75 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  61.43 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  61.07 
 
 		 285 aa  348  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  65.6 
 
 		 282 aa  339  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.84 
 
 		 285 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  53.41 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  53.41 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  49.82 
 
 		 286 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  53.57 
 
 		 293 aa  297  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  51.99 
 
 		 284 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  55.07 
 
 		 284 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  50.88 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  49.13 
 
 		 286 aa  289  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  57.19 
 
 		 286 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.52 
 
 		 285 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  51.26 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  49.47 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  51.79 
 
 		 286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  52.16 
 
 		 285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  51.65 
 
 		 283 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  50.36 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  51.43 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  50 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  51.61 
 
 		 286 aa  275  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  46.29 
 
 		 286 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.25 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  47.62 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  49.29 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  50.35 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  46.04 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  46.04 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.49 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  46.76 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  48.25 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.72 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  48.23 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  43.8 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  46.98 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  43.43 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  46.93 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  47.86 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  47.52 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  47.14 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  44.64 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  44.36 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  46.76 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  45.16 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  45.58 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  45.39 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  48.07 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  43.8 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  44.56 
 
 		 287 aa  232  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  47.87 
 
 		 285 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  47.52 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  46.29 
 
 		 285 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  40 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.71 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.71 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.11 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.07 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  37.09 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  38.91 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.21 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.68 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  35.64 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.92 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  39.35 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.91 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  39.05 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  38.32 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  37.5 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  40.21 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.72 
 
 		 282 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  40.56 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  40.56 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  40.21 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.33 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  37.32 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  39.51 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  37.07 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.63 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.2 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  38.93 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  36.69 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  37.72 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  35.38 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  32.99 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>