More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1818 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  95.47 
 
 
287 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  76.66 
 
 
287 aa  464  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  65.14 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  59.72 
 
 
285 aa  347  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  57.45 
 
 
285 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  55.4 
 
 
285 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  56.83 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  51.59 
 
 
285 aa  312  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  54.01 
 
 
287 aa  311  7.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  55.76 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  55.32 
 
 
285 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  55.04 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  52.46 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  53.96 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  53.96 
 
 
285 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  53.21 
 
 
301 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  51.57 
 
 
291 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  45.39 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  45.39 
 
 
290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  44.21 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  43.31 
 
 
282 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  43.66 
 
 
285 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  43.16 
 
 
285 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  44.17 
 
 
290 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  42.81 
 
 
285 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  42.11 
 
 
293 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  42.86 
 
 
285 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.86 
 
 
285 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  42.16 
 
 
284 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  40.21 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  43.31 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  40.35 
 
 
286 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  40.7 
 
 
293 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  40.7 
 
 
293 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  40.42 
 
 
284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  38.33 
 
 
286 aa  214  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  38.33 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  40.28 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.46 
 
 
285 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.93 
 
 
286 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  40.64 
 
 
285 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  39.93 
 
 
286 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  40.28 
 
 
286 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  38.89 
 
 
285 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  39.65 
 
 
284 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  39.58 
 
 
286 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  43.99 
 
 
286 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  38.81 
 
 
287 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  37.98 
 
 
286 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  39.78 
 
 
286 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  37.41 
 
 
288 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  39.29 
 
 
286 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  40.65 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  38.41 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.37 
 
 
285 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.73 
 
 
288 aa  191  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  35.56 
 
 
303 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  38.13 
 
 
291 aa  186  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  35.53 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.49 
 
 
286 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  33.69 
 
 
285 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  38.02 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 
288 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  37.64 
 
 
300 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  35.37 
 
 
293 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.01 
 
 
304 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.64 
 
 
306 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.96 
 
 
290 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  34.15 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  34.15 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.82 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.36 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  37.78 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.46 
 
 
283 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  37 
 
 
282 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.07 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.44 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  37.72 
 
 
285 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  35.27 
 
 
286 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  35.09 
 
 
286 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.92 
 
 
300 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  36.47 
 
 
284 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.16 
 
 
291 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
290 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.74 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  35.36 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.68 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  36.12 
 
 
290 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36 
 
 
297 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  34.67 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  36.27 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.13 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  34.98 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  34.67 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  35.64 
 
 
321 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>