More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4217 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 321 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  92.52 
 
 		 321 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  72.22 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  71.05 
 
 		 308 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  71.38 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  69.74 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  69.74 
 
 		 308 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  69.41 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  69.41 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  68.09 
 
 		 308 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  68.09 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  62.12 
 
 		 282 aa  355  5.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  62.33 
 
 		 282 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.87 
 
 		 300 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  50.99 
 
 		 303 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  52.41 
 
 		 293 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  48.98 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.16 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  52.07 
 
 		 304 aa  298  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  52.98 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  49 
 
 		 303 aa  271  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  48.01 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  47.99 
 
 		 285 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  48.44 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  46.02 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.33 
 
 		 291 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  46.94 
 
 		 286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  42.57 
 
 		 283 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.41 
 
 		 286 aa  223  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  37.46 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  45.33 
 
 		 285 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  44.64 
 
 		 285 aa  209  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  43.34 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  43.77 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.91 
 
 		 288 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.37 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.37 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  37.02 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  43 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.26 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  37.92 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  36.81 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  36.33 
 
 		 278 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  39.38 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  40.67 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  36.12 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.81 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  41.11 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.62 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.33 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  38.18 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  33.89 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  38.18 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  36.86 
 
 		 285 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  35.27 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  42.6 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  41.55 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  39.73 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  36.93 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  34.01 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  33.56 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.62 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  34.6 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  40.69 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  37.02 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  35.47 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  37.88 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  36.77 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.31 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  39.25 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  33.67 
 
 		 284 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  36.21 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  34.01 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  35.05 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  32.73 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  36.56 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>