More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0439 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  100 
 
 
315 aa  634    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  99.37 
 
 
315 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  95.03 
 
 
303 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  83.39 
 
 
308 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  83.06 
 
 
308 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  83.06 
 
 
308 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  82.06 
 
 
308 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  81.73 
 
 
308 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  80.4 
 
 
308 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  80.07 
 
 
308 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  72.22 
 
 
321 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  70.59 
 
 
321 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.14 
 
 
282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  59.11 
 
 
282 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  52.31 
 
 
293 aa  291  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.31 
 
 
300 aa  291  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  47.87 
 
 
304 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  52.82 
 
 
297 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  48.94 
 
 
286 aa  276  3e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  50.18 
 
 
303 aa  275  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.52 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  50 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.34 
 
 
288 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  52.6 
 
 
303 aa  261  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  49.83 
 
 
285 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  48.62 
 
 
282 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.11 
 
 
291 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  45.71 
 
 
300 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  44.37 
 
 
283 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  46.95 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.48 
 
 
286 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  39.29 
 
 
291 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  44.68 
 
 
285 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  44.1 
 
 
285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  43.57 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  43.97 
 
 
285 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  38.99 
 
 
282 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  38.99 
 
 
282 aa  195  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  45.21 
 
 
301 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  37.36 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  43.36 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  37.36 
 
 
278 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  36.88 
 
 
288 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  39.78 
 
 
287 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.18 
 
 
282 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.4 
 
 
288 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  37.33 
 
 
286 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  38.91 
 
 
285 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  39.45 
 
 
282 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  39.02 
 
 
290 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  35.77 
 
 
284 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  36.75 
 
 
285 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.79 
 
 
290 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  37.01 
 
 
288 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.79 
 
 
290 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  36.19 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  36.19 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  36.19 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  36.57 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  36.19 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.82 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.82 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  34.04 
 
 
303 aa  162  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  35.84 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
291 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
290 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 
294 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 
290 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 
294 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
291 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
290 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  35 
 
 
285 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  39.78 
 
 
281 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
294 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 
290 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  34.72 
 
 
290 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  35.34 
 
 
291 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  39.64 
 
 
282 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  35.87 
 
 
286 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  33.57 
 
 
306 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  33.57 
 
 
290 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  36.9 
 
 
286 aa  155  9e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  35.97 
 
 
287 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  38.35 
 
 
285 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  35.45 
 
 
291 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37.05 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  42.29 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  39.57 
 
 
286 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  40.36 
 
 
285 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  39.13 
 
 
285 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  39.11 
 
 
291 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 
285 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
285 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  37.36 
 
 
288 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>