More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4429 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  45.26 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  43.21 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.29 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.14 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  42.41 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  39.65 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  39.13 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  43.68 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  41.6 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  40.85 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  40 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  40 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  39.35 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  36.33 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  43.73 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  43.73 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  43.73 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  43.57 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  43.01 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.49 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  41.79 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  40.29 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  41.9 
 
 		 285 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.37 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  41.72 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  37.02 
 
 		 293 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  40.5 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  41.55 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  40.5 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  41.03 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  41.94 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  41.94 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  42.5 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.81 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  41.28 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.79 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.37 
 
 		 286 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.96 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  41.09 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  39.78 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  39.29 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  40 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  37.81 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  38.16 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 285 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  32.52 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  36.45 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  36.93 
 
 		 287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  37.29 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  40.29 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  36.71 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  36.71 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.49 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.63 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  38.21 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  39.86 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  36.33 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  36.33 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  37.72 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.1 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  37.41 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.85 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  35.84 
 
 		 286 aa  179  7e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  38.49 
 
 		 286 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  36.33 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  37.19 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  39.43 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.74 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  36.43 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  36.43 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  36.61 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  41.34 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  32.48 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  37.94 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  37.18 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  35.44 
 
 		 287 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.19 
 
 		 287 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  36.43 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  36.36 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  37.99 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  34.62 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  42.14 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  35.59 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>