More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0267 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  61.79 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  59.57 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  56.89 
 
 		 288 aa  332  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  54.12 
 
 		 285 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  53.02 
 
 		 283 aa  298  9e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  50.72 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.24 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  50.71 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  48.79 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.44 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  50 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.06 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.08 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  48.62 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  46.13 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.08 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  45.58 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.71 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.52 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  47.62 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  47.4 
 
 		 308 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  47.06 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  47.06 
 
 		 308 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  47.06 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  46.71 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  47.4 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  47.35 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  45.74 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  41.38 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  44.64 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  44.2 
 
 		 285 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  39.64 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  43.48 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  42.03 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  41.99 
 
 		 285 aa  218  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  44.49 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.43 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  41.73 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  40.94 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  38.01 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  39.05 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  39.05 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  38.38 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  39.34 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  37.36 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  39.46 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  39.38 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  39.38 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  39.38 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  39.38 
 
 		 290 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  39 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.93 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  39 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  37.93 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  39 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  43.01 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  38.37 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  36.59 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  35.87 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  36.26 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.42 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  35.9 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.75 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  40.07 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  35.56 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  36.13 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  37.86 
 
 		 288 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  35.51 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  36.26 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  32.73 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  32.73 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  37.45 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  38.95 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  35.87 
 
 		 295 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.73 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.81 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  38.83 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  38.35 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  36.13 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  37.73 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  37.87 
 
 		 301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.13 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  38.11 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  36.23 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>