More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3168 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 286 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  76.57 
 
 		 286 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  76.57 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  75.87 
 
 		 286 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  73.08 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  74.91 
 
 		 284 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  76.22 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  62.81 
 
 		 284 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  58.8 
 
 		 288 aa  363  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  60.63 
 
 		 284 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  58.06 
 
 		 286 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  58.06 
 
 		 286 aa  341  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.84 
 
 		 285 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  57.49 
 
 		 285 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  56.07 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  56.84 
 
 		 293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  56.84 
 
 		 293 aa  325  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  56.43 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  53.66 
 
 		 285 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  55.59 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  55.36 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  53.21 
 
 		 287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  54.29 
 
 		 285 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  55.2 
 
 		 285 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  56.1 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  56.43 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  54.12 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  53.76 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  56.43 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  50.54 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  50 
 
 		 283 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  50.36 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  50.36 
 
 		 290 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 		 288 aa  275  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  49.12 
 
 		 286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.3 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.39 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  44.68 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  44.1 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  48.4 
 
 		 281 aa  246  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  47.46 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  42.7 
 
 		 303 aa  234  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.44 
 
 		 285 aa  232  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  44.95 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  45.16 
 
 		 285 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  45.52 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  44.69 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  45.39 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  46.59 
 
 		 285 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  44.6 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  45.88 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  45.49 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  46.93 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  42.29 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  39.58 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  39.71 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  41.58 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  39.58 
 
 		 287 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  40.66 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  40.66 
 
 		 282 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  38.89 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  39.29 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  40.36 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  40.07 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  39.19 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  35.64 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  36.17 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.39 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  35.51 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36.3 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  36.16 
 
 		 290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.89 
 
 		 284 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  36.01 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  35.85 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  35.47 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  37.73 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  38.1 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  37.96 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  37.73 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  37.73 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  34.15 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  35.25 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.77 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.64 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  37.27 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  37.25 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  35.09 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.04 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  34.52 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>