More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0934 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  100 
 
 
293 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  91.47 
 
 
293 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
288 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  57.45 
 
 
283 aa  335  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  58.3 
 
 
286 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.95 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  56.84 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  56.34 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  55.52 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  55.44 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  51.77 
 
 
286 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  51.77 
 
 
286 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  54.23 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  53.93 
 
 
285 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  54.12 
 
 
290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  53.5 
 
 
286 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.15 
 
 
286 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.93 
 
 
285 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  51.93 
 
 
285 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  52.3 
 
 
285 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  53.41 
 
 
290 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  52.8 
 
 
286 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  53.41 
 
 
290 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  51.94 
 
 
285 aa  298  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  55.71 
 
 
282 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  49.47 
 
 
287 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  49.47 
 
 
286 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  51.04 
 
 
288 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  50 
 
 
286 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  51.06 
 
 
284 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  50 
 
 
286 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.74 
 
 
285 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  49.82 
 
 
285 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  55 
 
 
282 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  50.53 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.36 
 
 
288 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  48.03 
 
 
283 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  45.59 
 
 
288 aa  256  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  47.55 
 
 
287 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  43.15 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  46.38 
 
 
285 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  44.17 
 
 
288 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  45.23 
 
 
286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  45.52 
 
 
285 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  45.13 
 
 
285 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  44.77 
 
 
286 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  42.86 
 
 
301 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  40.43 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  45 
 
 
281 aa  235  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  45.2 
 
 
285 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  44.37 
 
 
286 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  45.85 
 
 
285 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  47.5 
 
 
285 aa  228  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  46.21 
 
 
285 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  40.77 
 
 
287 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  41.16 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  40.97 
 
 
287 aa  218  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  40.7 
 
 
287 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  45.16 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  36.36 
 
 
291 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37.13 
 
 
282 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37.13 
 
 
282 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  37.41 
 
 
285 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  36.75 
 
 
283 aa  185  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  35.69 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.97 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  38.32 
 
 
278 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.11 
 
 
300 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  36.86 
 
 
278 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.87 
 
 
286 aa  176  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.43 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  35.35 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  35.79 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  35.84 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  34.77 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  33.21 
 
 
286 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  35.71 
 
 
304 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  34.15 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  34.87 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  33.1 
 
 
291 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 
291 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.02 
 
 
303 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  34.51 
 
 
291 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  35.86 
 
 
294 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  33.96 
 
 
290 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  33.8 
 
 
291 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  35.77 
 
 
285 aa  165  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  33.8 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  34.15 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  35.61 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  33.45 
 
 
291 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>