More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2631 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  57.3 
 
 
285 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  54.61 
 
 
283 aa  314  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  55 
 
 
294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.29 
 
 
288 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  52.33 
 
 
286 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.43 
 
 
286 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  51.08 
 
 
291 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  50.72 
 
 
282 aa  279  4e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  53.36 
 
 
286 aa  278  6e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  45.29 
 
 
291 aa  262  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  46.89 
 
 
297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  44.56 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  45.82 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.62 
 
 
282 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  47.33 
 
 
303 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.02 
 
 
321 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.06 
 
 
300 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  42.91 
 
 
293 aa  248  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  48.75 
 
 
308 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  48.03 
 
 
308 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  43.97 
 
 
285 aa  245  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  45.33 
 
 
321 aa  244  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  48.39 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  41.96 
 
 
288 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.93 
 
 
282 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.03 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  48.03 
 
 
308 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  48.03 
 
 
308 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  43.77 
 
 
303 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  47.67 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  45.71 
 
 
315 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  45.88 
 
 
303 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  43.48 
 
 
285 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  41.94 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  42.39 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  39.93 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  41.13 
 
 
285 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  41.18 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  39.21 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  40 
 
 
290 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  40 
 
 
290 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  40 
 
 
290 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  41.7 
 
 
285 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.29 
 
 
286 aa  204  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.55 
 
 
282 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37.73 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37.73 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
288 aa  199  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  40 
 
 
301 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  40.29 
 
 
295 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  36.26 
 
 
288 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  35.23 
 
 
303 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  41.24 
 
 
287 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  39.07 
 
 
286 aa  191  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  35.9 
 
 
285 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  40.51 
 
 
286 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
291 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
291 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  39.54 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
291 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  41.67 
 
 
285 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  38.78 
 
 
291 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  39.08 
 
 
291 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  39.11 
 
 
282 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  38.78 
 
 
291 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  38.15 
 
 
287 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  36.52 
 
 
291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.7 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  40.16 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 
291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  40.91 
 
 
285 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  38.52 
 
 
287 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  39.16 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  35.56 
 
 
284 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  35.64 
 
 
286 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  36.29 
 
 
286 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  38.35 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  38.46 
 
 
286 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  38.98 
 
 
287 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  40.73 
 
 
285 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37.64 
 
 
287 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  36.13 
 
 
286 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.71 
 
 
285 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  36.3 
 
 
284 aa  176  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  38.08 
 
 
290 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  36.92 
 
 
290 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  38.02 
 
 
290 aa  175  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  36.92 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  36.92 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  38.32 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>