More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1309 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  76.95 
 
 		 282 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  76.95 
 
 		 282 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  45.98 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  44.15 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 290 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  43.61 
 
 		 294 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  43.61 
 
 		 294 aa  228  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  43.77 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  42.65 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  43.23 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  42.65 
 
 		 306 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  43.35 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  42.12 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.88 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  38.32 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  38.79 
 
 		 285 aa  211  9e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  42.91 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  40.29 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.24 
 
 		 282 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  39.21 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 291 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  39.57 
 
 		 291 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  39.57 
 
 		 291 aa  205  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  37.55 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  39.65 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  38.85 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  39.86 
 
 		 278 aa  201  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  39.21 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  38.99 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  41.3 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  40.07 
 
 		 290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.36 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  37.91 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  36.07 
 
 		 294 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  40.07 
 
 		 286 aa  194  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  39.49 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  38.65 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  38.21 
 
 		 286 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  38.77 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  38.43 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  37.5 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  35.59 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  38.41 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  38.41 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  38.41 
 
 		 308 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  34.13 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  37.15 
 
 		 321 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  39.48 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  39.78 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  36.75 
 
 		 287 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  39.48 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  37.05 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  38.66 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  38.41 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  39.42 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  34.78 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.91 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.6 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.81 
 
 		 321 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.91 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  37.72 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  36.4 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  35 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  36.88 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  33.45 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  37.55 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.68 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  36.65 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  35.69 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  37.64 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  36.36 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  35.97 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  37.77 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  39.03 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  36.75 
 
 		 286 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  37.87 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  38.08 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  38.43 
 
 		 285 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  38.43 
 
 		 285 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  39.86 
 
 		 291 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  37.18 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  34.97 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  38.13 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  34.98 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  37.14 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  36.3 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  37.73 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  37.37 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>