More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0312 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  62.87 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  58.61 
 
 		 293 aa  357  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.45 
 
 		 300 aa  354  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  58.62 
 
 		 304 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  55.59 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  56.38 
 
 		 297 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  50.81 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.16 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.69 
 
 		 282 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.08 
 
 		 282 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.87 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  49.82 
 
 		 286 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  54.51 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  53.43 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  53.43 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  53.43 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  53.43 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  53.43 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  53.24 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  52.52 
 
 		 315 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.6 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  47.16 
 
 		 285 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.48 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  48.43 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  47.33 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  46.83 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  46.32 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.55 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  43.82 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.31 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  40.49 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  38.25 
 
 		 285 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  40 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  40 
 
 		 285 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  37.32 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  34.15 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  39.29 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  33.69 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  36.33 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  41.33 
 
 		 285 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  33.8 
 
 		 278 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  38.79 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.74 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  34.4 
 
 		 288 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  33.33 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  33.33 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  33.1 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  39.22 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  32.97 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  37.32 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  35.76 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  33.92 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  36.14 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  33.72 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  37.01 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  36.84 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  33.07 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  38.87 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  34.02 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  34.02 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  38.87 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  34.63 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  38.95 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  35.96 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  34.22 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.16 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  39.86 
 
 		 286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  34.63 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  35.92 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  35.36 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  34.98 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  35.46 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  38.57 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.43 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  33.22 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  35.11 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  32.04 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  36.49 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.01 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.01 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  33.08 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  31.02 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  34.86 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  35.23 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  35.47 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  34.77 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  32.58 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>