More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1524 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  63.16 
 
 
286 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  54.04 
 
 
288 aa  323  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  57.5 
 
 
285 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  52.46 
 
 
287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  51.76 
 
 
287 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  54.04 
 
 
287 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  52.28 
 
 
287 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  53.76 
 
 
285 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  54.48 
 
 
285 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  49.64 
 
 
285 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  53.71 
 
 
285 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  52.65 
 
 
285 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  53.41 
 
 
285 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  52.69 
 
 
285 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  50.72 
 
 
301 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  48.21 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  51.79 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  47.12 
 
 
290 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  46.76 
 
 
290 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  46.76 
 
 
290 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  44.37 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  47.12 
 
 
284 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  43.66 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  44.72 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  46.26 
 
 
286 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  44.84 
 
 
285 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.2 
 
 
286 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  45.2 
 
 
286 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  44.48 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  44.21 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  43.86 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  44.83 
 
 
282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  43.51 
 
 
285 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  44.09 
 
 
286 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  45.04 
 
 
285 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  40.7 
 
 
286 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  44.84 
 
 
286 aa  228  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  40.35 
 
 
287 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  43.53 
 
 
285 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  45.85 
 
 
285 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.29 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  40.91 
 
 
286 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  41.58 
 
 
286 aa  223  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  45.49 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  40.64 
 
 
286 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  40.28 
 
 
286 aa  220  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  39.86 
 
 
288 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.73 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  45.52 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.66 
 
 
288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  40.94 
 
 
284 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  41.82 
 
 
285 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  41.3 
 
 
283 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  37.09 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  40.89 
 
 
294 aa  198  9e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  38.93 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  39.36 
 
 
283 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.48 
 
 
291 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  37.91 
 
 
304 aa  192  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  37.05 
 
 
282 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  37.05 
 
 
282 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  42.2 
 
 
283 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.77 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.43 
 
 
286 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  38.63 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  39.64 
 
 
285 aa  188  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  36.75 
 
 
286 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  39.85 
 
 
287 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  37.45 
 
 
306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.87 
 
 
291 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  35.66 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.4 
 
 
288 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.73 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.77 
 
 
282 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  36.43 
 
 
286 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  37.08 
 
 
290 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  38.25 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  36.47 
 
 
290 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
290 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.32 
 
 
303 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  36.47 
 
 
294 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  36.47 
 
 
294 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  36.47 
 
 
290 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  36.47 
 
 
290 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  38.35 
 
 
297 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  36.88 
 
 
291 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.4 
 
 
300 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
290 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  36.09 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.2 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.23 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  36.17 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  34.63 
 
 
303 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  35.11 
 
 
291 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  35.92 
 
 
291 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 
290 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>