More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0246 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 303 aa  628  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  80.47 
 
 		 300 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  70.21 
 
 		 293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  71.81 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  66.21 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.59 
 
 		 303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.87 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.52 
 
 		 282 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.99 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  50.33 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  49.83 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.18 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  50.54 
 
 		 308 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  50.54 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  49.46 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  50.18 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  49.46 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 308 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  49.1 
 
 		 308 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  47.72 
 
 		 286 aa  271  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  45.07 
 
 		 285 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.1 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  43.77 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  47.35 
 
 		 282 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  42.46 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.51 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  41.9 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.99 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.33 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.79 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  37.41 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  36.46 
 
 		 288 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  35.54 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.3 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  34.84 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  38.19 
 
 		 285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  33.57 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  36.59 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.25 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  35.13 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  35.13 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  33.22 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  33.68 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  33.8 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  34.77 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  36.9 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  31.32 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  32.39 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  32.39 
 
 		 282 aa  169  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  32.03 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  32.86 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  33.1 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  32.13 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  34.15 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  34.03 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  32.76 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  32.76 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  34.63 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  32.17 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  33.91 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  33.57 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  34.16 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  34.52 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  32.98 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  34.86 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  31.78 
 
 		 284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  32.68 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  32.86 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  34.4 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.17 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  32.87 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  32.51 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  33.33 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  35.23 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  31.14 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  31.49 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  32.74 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  32.14 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  33.1 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  30.48 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  31.67 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.21 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  32.14 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  30.34 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  31.39 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  31.32 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  31.07 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>