More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2868 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  94.76 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  71.33 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  69.93 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  64.44 
 
 		 286 aa  387  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  62.68 
 
 		 286 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  55 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.71 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  55.71 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  55.36 
 
 		 286 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  55.91 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  55.56 
 
 		 284 aa  315  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  51.77 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  54.64 
 
 		 286 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.69 
 
 		 285 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  52.69 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  50.71 
 
 		 293 aa  299  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  52.16 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  54.15 
 
 		 284 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  50.18 
 
 		 285 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.58 
 
 		 285 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  50 
 
 		 282 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  46.98 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  49.65 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  48.19 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  47.12 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  47.12 
 
 		 285 aa  279  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  46.76 
 
 		 285 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  48.57 
 
 		 282 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  44.72 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 		 288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  46.04 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  46.04 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  45.39 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  45.68 
 
 		 290 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  44.8 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.1 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  44.68 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  45.52 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  44.21 
 
 		 286 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  45.2 
 
 		 285 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  46.98 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  40.57 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  46.93 
 
 		 285 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  40.21 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  43.37 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  43.01 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  43.62 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  44.84 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  45.88 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  45.16 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  43.51 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  41.9 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  40.91 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  38.33 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  40.64 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  41.37 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  38.21 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.85 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.85 
 
 		 282 aa  191  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  36.2 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  36.43 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.43 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.25 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  35.29 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35.11 
 
 		 291 aa  169  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  35.76 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  33.45 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.45 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  36.07 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  34.29 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.14 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  35.77 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  33.57 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.15 
 
 		 300 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  36.72 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  34.02 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  35.57 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  32.85 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  35.02 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.4 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  34.68 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  34.15 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  33.1 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.76 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  31.56 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.41 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>