More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0499 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  100 
 
 		 321 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  92.52 
 
 		 321 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  72.48 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  71.48 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  71.48 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  71.81 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  71.81 
 
 		 308 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  71.05 
 
 		 303 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  70.59 
 
 		 315 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  70.13 
 
 		 308 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  70.81 
 
 		 308 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  61.64 
 
 		 282 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  60.27 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.9 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  52.76 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  50.33 
 
 		 303 aa  305  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.81 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  50.33 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  48.64 
 
 		 286 aa  298  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  50.48 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  48.4 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.67 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  47.99 
 
 		 285 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  47.52 
 
 		 294 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  48.79 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.15 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  45.33 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  43.58 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  45.92 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.18 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  37.11 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  43.71 
 
 		 285 aa  205  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  44.9 
 
 		 285 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  42.71 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  40.07 
 
 		 282 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.93 
 
 		 286 aa  199  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  40.07 
 
 		 282 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  42.31 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.44 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  39.67 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.15 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  42.66 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  36.33 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  40 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  35.64 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  41.81 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  39.86 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  36.73 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  34.81 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  37.16 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  37.16 
 
 		 290 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  41.61 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  34.47 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  34.57 
 
 		 284 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  41.52 
 
 		 282 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  36.77 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.42 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  37.46 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  36.43 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  36.39 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  35.64 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  35.85 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  38.7 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.76 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  33.9 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  36.33 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  35.05 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  35.29 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.54 
 
 		 285 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  36.56 
 
 		 285 aa  159  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 290 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  31.83 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  34.34 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  34.01 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  32.53 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  32.87 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  35.14 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  31.49 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  39.31 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  36.73 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  31.19 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>