More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6843 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  100 
 
 
282 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  86.17 
 
 
282 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  74.82 
 
 
285 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  68.93 
 
 
285 aa  381  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  68.57 
 
 
285 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  68.21 
 
 
285 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  65.6 
 
 
290 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  65.6 
 
 
290 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  65.36 
 
 
290 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  58.57 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  54.68 
 
 
285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  56.07 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.76 
 
 
285 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  55.04 
 
 
284 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  55.4 
 
 
285 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  55 
 
 
293 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  57.14 
 
 
286 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  55.76 
 
 
288 aa  308  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  57.14 
 
 
286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  55.76 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  56.07 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  56.43 
 
 
286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  55 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  55 
 
 
293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  61.48 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  56.57 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  50.18 
 
 
286 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  48.75 
 
 
287 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  52.3 
 
 
286 aa  296  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  51.79 
 
 
286 aa  296  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.56 
 
 
285 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  48.93 
 
 
286 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  48.57 
 
 
286 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  49.47 
 
 
286 aa  285  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  53.21 
 
 
285 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  54.18 
 
 
285 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.9 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  49.63 
 
 
288 aa  272  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  46.91 
 
 
303 aa  270  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  50.71 
 
 
288 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  48.75 
 
 
288 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  51.07 
 
 
283 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  48.75 
 
 
285 aa  256  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  49.3 
 
 
287 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  47.83 
 
 
286 aa  254  8e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  51.26 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  50.55 
 
 
285 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  48.04 
 
 
286 aa  248  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  51.07 
 
 
285 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 
291 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  43.27 
 
 
285 aa  244  8e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  45.77 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  45.77 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  50.71 
 
 
285 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  48.21 
 
 
281 aa  236  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  47.79 
 
 
285 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  51.08 
 
 
285 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  48.41 
 
 
285 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  47.69 
 
 
301 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  45.52 
 
 
286 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  42.61 
 
 
287 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.82 
 
 
286 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.86 
 
 
282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  43.53 
 
 
294 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.39 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  42.86 
 
 
282 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  40.49 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.56 
 
 
291 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  40.29 
 
 
288 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  39.78 
 
 
282 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  39.78 
 
 
282 aa  195  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  42.7 
 
 
283 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  38.41 
 
 
300 aa  193  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  36.82 
 
 
291 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  39.71 
 
 
285 aa  191  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  39.54 
 
 
286 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.6 
 
 
321 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  37.63 
 
 
293 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  42.18 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  41.52 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  35.13 
 
 
278 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  38.55 
 
 
297 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  36.17 
 
 
304 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  37.92 
 
 
282 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  34.4 
 
 
278 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  42.39 
 
 
308 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  42.39 
 
 
308 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  37.23 
 
 
291 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.79 
 
 
300 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  42.39 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  42.39 
 
 
308 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  38.71 
 
 
295 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.03 
 
 
308 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  42.03 
 
 
308 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  38.75 
 
 
288 aa  175  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  40.94 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.38 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  37.59 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  37.32 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>