More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3425 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  83.86 
 
 		 285 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3100  aminotransferase, class IV  83.16 
 
 		 285 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712487 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  58.89 
 
 		 286 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  58.54 
 
 		 286 aa  338  5e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  57.49 
 
 		 286 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1208  aminotransferase class IV  56.49 
 
 		 284 aa  334  9e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.621738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  56.14 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  55.75 
 
 		 286 aa  328  7e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  55.12 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  56.64 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  53.66 
 
 		 286 aa  321  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1218  aminotransferase class IV  56.47 
 
 		 286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  54.12 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  54.42 
 
 		 286 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  56.27 
 
 		 285 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  55.12 
 
 		 286 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  50.9 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  52.65 
 
 		 288 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 286 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  53.96 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3562  aminotransferase class IV  49.64 
 
 		 283 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6843  aminotransferase class IV  54.68 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  53.07 
 
 		 285 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  48.95 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  49.82 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  49.47 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  51.99 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1647  D-amino acid aminotransferase  53.5 
 
 		 286 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  51.26 
 
 		 285 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2359  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.82 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.74058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  50.9 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  50 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  50 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  43.53 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5171  aminotransferase class IV  48.2 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623088  normal  0.871234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  47.74 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.65 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  48.57 
 
 		 285 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  47.33 
 
 		 286 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  42.65 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  39.72 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1840  D-amino acid aminotransferase  47.12 
 
 		 285 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  45.32 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  47.64 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  45.49 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  43.21 
 
 		 288 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1448  D-amino acid aminotransferase  47.12 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  40.94 
 
 		 286 aa  228  8e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1682  D-amino acid aminotransferase  43.16 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  44.84 
 
 		 286 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  46.4 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  43.68 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  38.55 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  43.88 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  43.17 
 
 		 285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2879  D-amino acid aminotransferase  43.93 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  38.89 
 
 		 287 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.41 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  39.64 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  40.73 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  39.43 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.3 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  38.1 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  33.69 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  33.69 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  35 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.2 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  38.43 
 
 		 283 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  35.48 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.84 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  36.52 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.02 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  33.09 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.26 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  36.56 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  33.09 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.56 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.67 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  37.4 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  38.71 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  33.46 
 
 		 284 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  34.81 
 
 		 288 aa  149  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  35.51 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  32.51 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.17 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  34.33 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  33.21 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  32.96 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  35.25 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  31.94 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  33.57 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  32.83 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  33.95 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>