More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0351 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
293 aa  588  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  74.06 
 
 
293 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  71.82 
 
 
297 aa  447  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  71.48 
 
 
292 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  64.95 
 
 
292 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  62.67 
 
 
299 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  61.67 
 
 
293 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  60.42 
 
 
293 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  61.84 
 
 
299 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  61.48 
 
 
299 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  61.13 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  60.42 
 
 
299 aa  371  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  60.78 
 
 
299 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  62.54 
 
 
291 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  58.13 
 
 
290 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  58.54 
 
 
299 aa  355  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  58.33 
 
 
299 aa  354  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  57.09 
 
 
298 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  57.09 
 
 
298 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  349  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  349  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  348  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  349  4e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  348  4e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  348  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  57.49 
 
 
295 aa  348  9e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  56.75 
 
 
298 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  58.04 
 
 
295 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  56.9 
 
 
297 aa  342  4e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  56.64 
 
 
288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  55.05 
 
 
297 aa  333  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  56.06 
 
 
292 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  55.21 
 
 
289 aa  329  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  54.67 
 
 
347 aa  328  9e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  57.84 
 
 
288 aa  323  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  53.63 
 
 
292 aa  323  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 
288 aa  323  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  54.06 
 
 
288 aa  316  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  53.96 
 
 
287 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  54.32 
 
 
287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  51.57 
 
 
286 aa  309  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  52.88 
 
 
287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  49.13 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  48.77 
 
 
303 aa  292  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  47.5 
 
 
282 aa  276  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  43.45 
 
 
307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
307 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 
307 aa  222  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 
306 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  42.41 
 
 
307 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  41.38 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  41.11 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  42.07 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  41.72 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  39.86 
 
 
311 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  42.2 
 
 
307 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  42.2 
 
 
317 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  41.49 
 
 
309 aa  208  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  42.03 
 
 
306 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  42.45 
 
 
306 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  42.61 
 
 
307 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  43.01 
 
 
302 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  41.94 
 
 
308 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  41.61 
 
 
312 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  39.58 
 
 
302 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  39.37 
 
 
309 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2994  branched-chain amino acid aminotransferase  38.49 
 
 
319 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.127266  normal  0.646226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  39.1 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.41 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
307 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  37.02 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  39.66 
 
 
306 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5244  aminotransferase class IV  41.2 
 
 
317 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  40.14 
 
 
307 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  40.35 
 
 
312 aa  198  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  39.65 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  37.63 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  37.58 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  38.75 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  37.14 
 
 
307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0136  branched-chain amino acid aminotransferase  39.71 
 
 
309 aa  196  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0596945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.95 
 
 
308 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  37.14 
 
 
307 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  39.57 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  35.99 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1404  branched-chain amino acid aminotransferase  39.35 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  37.72 
 
 
309 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
312 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  38.43 
 
 
308 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  40.78 
 
 
306 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1707  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 
304 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>