More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1990 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  61.79 
 
 		 282 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  55.52 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  55.87 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  54.26 
 
 		 288 aa  322  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.98 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  48.64 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  52.33 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  52.28 
 
 		 283 aa  299  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.1 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.82 
 
 		 303 aa  294  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.35 
 
 		 286 aa  291  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.82 
 
 		 282 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  48.06 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  49.31 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  46.05 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  48.94 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.55 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  48.58 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  46.1 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  47.72 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  50.55 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  50.55 
 
 		 308 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  50.18 
 
 		 308 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  50.18 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  48.58 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  43.46 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  45.3 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  44.2 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  41.07 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  41.07 
 
 		 285 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  40.36 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  40.29 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  40.93 
 
 		 285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  41.09 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  36.62 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  39.35 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  38.13 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  37.59 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  36.13 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  38.77 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  34.78 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  34.78 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  34.78 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  36.26 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  36.13 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  36.1 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  36.1 
 
 		 290 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  39.56 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  34.48 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  38.69 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  37.68 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  34.07 
 
 		 288 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  37.68 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  37.65 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 290 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  38.04 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  39.15 
 
 		 285 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1476  D-amino acid aminotransferase  39.57 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  37.68 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  37.32 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  36.96 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2866  D-amino acid aminotransferase  34.89 
 
 		 285 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.908947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  39.92 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  36.07 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  37.97 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1427  D-amino acid aminotransferase  34.75 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  35.61 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  35.45 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2581  D-amino acid aminotransferase  36.7 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  34.5 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3455  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.85 
 
 		 285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  35.9 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3425  aminotransferase, class IV  38.1 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0934  D-amino acid aminotransferase  34.4 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0876  D-amino acid aminotransferase  34.4 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  35.77 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  35.82 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>