More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1735 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  77.35 
 
 
288 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  78.05 
 
 
347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  77.35 
 
 
297 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  73.08 
 
 
297 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  69.34 
 
 
292 aa  428  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  68.66 
 
 
303 aa  413  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  66.09 
 
 
292 aa  408  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  59.38 
 
 
297 aa  353  1e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  57.99 
 
 
293 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  58.6 
 
 
287 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  56.25 
 
 
292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  55.02 
 
 
293 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  56.84 
 
 
287 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  56.84 
 
 
287 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  56.58 
 
 
292 aa  329  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  55.21 
 
 
293 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  56.29 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  56.18 
 
 
299 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  55.83 
 
 
299 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  55.48 
 
 
299 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  55.56 
 
 
286 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  52.94 
 
 
291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  55.9 
 
 
288 aa  318  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 
299 aa  316  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
286 aa  315  7e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  53.5 
 
 
299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  52.45 
 
 
295 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  53.36 
 
 
299 aa  308  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  53.12 
 
 
290 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  7e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  52.43 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  52.08 
 
 
298 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  51.21 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  51.05 
 
 
288 aa  295  9e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  51.03 
 
 
295 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  51.94 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  46.07 
 
 
282 aa  269  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.76 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  44.84 
 
 
308 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  44.76 
 
 
307 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 
308 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 
306 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4059  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
308 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0156  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
308 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0484  branched-chain amino acid aminotransferase  44.48 
 
 
308 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.308997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  44.44 
 
 
307 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  45.14 
 
 
307 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  45.2 
 
 
308 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  42.7 
 
 
306 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  45.83 
 
 
307 aa  227  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  43 
 
 
307 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  43 
 
 
307 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
308 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  45.2 
 
 
308 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
307 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  43.1 
 
 
309 aa  225  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  45.58 
 
 
312 aa  225  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  42.56 
 
 
307 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0041  branched-chain amino acid aminotransferase  42.36 
 
 
319 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
309 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4078  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.84 
 
 
304 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  42.91 
 
 
307 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  44.64 
 
 
308 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
307 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
309 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
309 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
309 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  43.01 
 
 
306 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
308 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  42.35 
 
 
307 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  43.77 
 
 
308 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 
309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  42.21 
 
 
305 aa  222  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  42.55 
 
 
307 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4113  branched-chain amino acid aminotransferase  43.42 
 
 
309 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  41.28 
 
 
312 aa  222  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>