More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2112 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  100 
 
 		 280 aa  553  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  73.57 
 
 		 280 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  62.63 
 
 		 274 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  58.93 
 
 		 276 aa  317  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  56.63 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  58.57 
 
 		 278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  54.58 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.81 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  54.12 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  52.13 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  50.17 
 
 		 287 aa  217  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.79 
 
 		 313 aa  201  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  35.02 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  34.39 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  39.7 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  37.92 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  32.49 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  33.45 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  36.57 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  32.62 
 
 		 293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  31.77 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.77 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  32.21 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  31.12 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.28 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.7 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  31.91 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.77 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  28.96 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  31.16 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  31.43 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  33.83 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.36 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  31.21 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.28 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.64 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  32.19 
 
 		 309 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  31.58 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  31.32 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  30.34 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.82 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  33.56 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  33.57 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.17 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.51 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0071  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.29 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  31.64 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 299 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  32.6 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.09 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.3 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  31.19 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.25 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  28.22 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  35.76 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2928  aminotransferase class IV  31.44 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.213699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  33.68 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  33.08 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  32.03 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  34.7 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  27.27 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  31.41 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  32.8 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  30.5 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  33.1 
 
 		 280 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.52 
 
 		 290 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0068  4-amino-4-deoxychorismate lyase  32.85 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  35.66 
 
 		 263 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  31.62 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  29.72 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.94 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 290 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>