More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2019 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  78.48 
 
 
312 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  74.01 
 
 
309 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  73.36 
 
 
309 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  70.72 
 
 
304 aa  451  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  68.32 
 
 
339 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  52.96 
 
 
311 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
312 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  53.8 
 
 
312 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  51.83 
 
 
308 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
307 aa  315  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
307 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  48.17 
 
 
312 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  51.99 
 
 
307 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  52.49 
 
 
307 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  51.5 
 
 
306 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  50.99 
 
 
307 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  48.17 
 
 
312 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  47.51 
 
 
312 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
307 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  52.22 
 
 
307 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  50.66 
 
 
307 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 
303 aa  308  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  51.66 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  52.26 
 
 
309 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2135  branched-chain amino acid aminotransferase  51.74 
 
 
311 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  52.33 
 
 
309 aa  308  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  51.32 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  49.34 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  52.32 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0626  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000994351  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  48.78 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
310 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  51.16 
 
 
306 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  51.34 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  50.83 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  53 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  48.34 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 
307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  51.01 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  48 
 
 
305 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  49.5 
 
 
305 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  51.74 
 
 
307 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 
303 aa  298  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  48.64 
 
 
307 aa  298  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 
308 aa  298  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  47.39 
 
 
317 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  48.64 
 
 
307 aa  297  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  46.64 
 
 
303 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  50.52 
 
 
307 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  48.29 
 
 
316 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  48.64 
 
 
308 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  45.67 
 
 
303 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  46.98 
 
 
303 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 
308 aa  295  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 
308 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  49.17 
 
 
306 aa  295  8e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  52.36 
 
 
304 aa  295  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  47.68 
 
 
313 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  48.18 
 
 
307 aa  293  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  51.04 
 
 
307 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.5 
 
 
308 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2699  branched-chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 
306 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  46.98 
 
 
303 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4758  branched-chain amino acid aminotransferase  48.66 
 
 
308 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  47.14 
 
 
296 aa  292  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1449  branched-chain amino acid aminotransferase  48.33 
 
 
308 aa  292  6e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.295507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  46.31 
 
 
303 aa  291  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  51.22 
 
 
307 aa  290  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0981  branched-chain amino acid aminotransferase  46.69 
 
 
309 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 
307 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 
307 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  49.32 
 
 
309 aa  289  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>