More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1383 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1383  aminotransferase class IV  100 
 
 
276 aa  550  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.778561  normal  0.0488839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  37.35 
 
 
276 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  34.62 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  33.45 
 
 
276 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3272  aminotransferase class IV  37.85 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.84 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  35.52 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  34.47 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2112  putative aminotransferase  33.2 
 
 
280 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2367  aminotransferase, class IV  34.13 
 
 
274 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  30.22 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  29.3 
 
 
281 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  29.34 
 
 
282 aa  89  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.97 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  31.46 
 
 
285 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  29.36 
 
 
277 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  29.15 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15470  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.4 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0160772  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  33.46 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.67 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.73 
 
 
297 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  27.94 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.33 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  31.15 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  25.56 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.95 
 
 
290 aa  75.5  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  29.52 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  28.79 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3708  aminotransferase, class IV  29.92 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464528  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  30.22 
 
 
288 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  31.92 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  26.1 
 
 
303 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  28.14 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  28.35 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  28.35 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  26.77 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  30.59 
 
 
741 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  28.57 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2483  aminotransferase class IV  27.17 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  25.28 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  28.15 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  28.63 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  27.19 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.09 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  22.82 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  27.27 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  22.82 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1339  aminotransferase class IV  25.26 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  29.03 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.23 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  28.31 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.23 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  25.68 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  23.08 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.35 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  30.67 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  25.23 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  25.23 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.75 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.12 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  26.62 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  30.42 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  28.21 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  25.65 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  22.81 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  29.93 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  27.47 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.79 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.75 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2794  D-amino-acid transaminase  25.1 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  26.07 
 
 
293 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  26.75 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.96 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.96 
 
 
292 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  28.02 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  29.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.14 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  25.99 
 
 
309 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.71 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.29 
 
 
601 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>