More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2114 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  100 
 
 		 601 aa  1211    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.28 
 
 		 611 aa  501  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.95 
 
 		 618 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.56 
 
 		 615 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.99 
 
 		 607 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  43.89 
 
 		 590 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.09 
 
 		 587 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  42.98 
 
 		 629 aa  432  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2808  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.21 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.01 
 
 		 574 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.9 
 
 		 599 aa  424  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.03 
 
 		 584 aa  422  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.62 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.07 
 
 		 615 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.86 
 
 		 573 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  42.22 
 
 		 596 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  44.86 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.14 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.81 
 
 		 599 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  47.65 
 
 		 555 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0809  para-aminobenzoate synthetase component I  38.68 
 
 		 572 aa  389  1e-107  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.55 
 
 		 621 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2819  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.55 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.31 
 
 		 591 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.03 
 
 		 599 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  42.72 
 
 		 612 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  41.18 
 
 		 623 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1528  chorismate binding enzyme  37.37 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0770675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  43.53 
 
 		 615 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.02 
 
 		 638 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1629  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.52 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.810406  normal  0.772192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  41.42 
 
 		 637 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.42 
 
 		 630 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.1 
 
 		 632 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.18 
 
 		 632 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.95 
 
 		 710 aa  359  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  41.81 
 
 		 595 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  43.99 
 
 		 637 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  44.18 
 
 		 620 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.99 
 
 		 637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  43.55 
 
 		 648 aa  357  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  44.25 
 
 		 635 aa  357  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  45.92 
 
 		 640 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  45.51 
 
 		 626 aa  347  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31460  aminodeoxychorismate synthase, component I  42.13 
 
 		 587 aa  347  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  42.72 
 
 		 644 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.17 
 
 		 595 aa  341  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.71 
 
 		 635 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2871  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.15 
 
 		 617 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.872704  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  41.42 
 
 		 669 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.37 
 
 		 629 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  43.13 
 
 		 639 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  41.82 
 
 		 668 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  41.82 
 
 		 668 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  41.82 
 
 		 668 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  41.82 
 
 		 668 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  41.82 
 
 		 668 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  41.74 
 
 		 669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  41.82 
 
 		 668 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0427  para-aminobenzoate synthase component I  38.68 
 
 		 586 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.75 
 
 		 607 aa  317  5e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0949  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.72 
 
 		 594 aa  306  8.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.969894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0878  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.52 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0178377  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1011  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase, component I  34.72 
 
 		 594 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00630898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  43.4 
 
 		 673 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2685  aminodeoxychorismate synthase  45.6 
 
 		 385 aa  297  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.627045 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0075  aminodeoxychorismate synthase  45.28 
 
 		 389 aa  297  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0080  aminodeoxychorismate synthase  44.74 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0984  para-aminobenzoate synthase component I, ADC synthase  31.19 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2729  aminodeoxychorismate synthase  47.65 
 
 		 385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4261  aminodeoxychorismate synthase  44.99 
 
 		 386 aa  286  9e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3598  aminodeoxychorismate synthase  44.59 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3297  aminodeoxychorismate synthase  45.16 
 
 		 386 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0633  aminodeoxychorismate synthase  46.85 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0817  aminodeoxychorismate synthase  47.91 
 
 		 390 aa  272  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.244151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2474  aminodeoxychorismate synthase  47.35 
 
 		 381 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0362  aminodeoxychorismate synthase  47.22 
 
 		 390 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.969651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3703  aminodeoxychorismate synthase  40.86 
 
 		 411 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4435  aminodeoxychorismate synthase  44.17 
 
 		 388 aa  246  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.980894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0615  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.55 
 
 		 434 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0184347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1460  para-aminobenzoate synthetase component I  36 
 
 		 430 aa  237  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1531  para-aminobenzoate synthase, component I  36 
 
 		 430 aa  237  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0198391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  33.27 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0761  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  50 
 
 		 480 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00689032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2217  Anthranilate synthase  35.46 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  44.52 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.74 
 
 		 509 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3709  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.89 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.64 
 
 		 732 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2282  para-aminobenzoate synthase, component I  37.8 
 
 		 447 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2489  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.74 
 
 		 450 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.995596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0310  para-aminobenzoate synthase subunit I  45.52 
 
 		 731 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.764542  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3441  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.47 
 
 		 446 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.165504  normal  0.0282408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2080  para-aminobenzoate synthase component I  37.83 
 
 		 447 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  hitchhiker  0.00512138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.28 
 
 		 469 aa  220  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3444  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.59 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.716101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  37.28 
 
 		 408 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.49 
 
 		 732 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2329  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.23 
 
 		 446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>