More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0311 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  83.51 
 
 		 287 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  50.72 
 
 		 281 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  42.59 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.69 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.62 
 
 		 293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  39.76 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.8 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  37.41 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.43 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.64 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  37.4 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  41.46 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.59 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.22 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  28.91 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.27 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.04 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.61 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  28.4 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.53 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  30.67 
 
 		 291 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  27.48 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  25.72 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.42 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  33.21 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.72 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  32.52 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  27.69 
 
 		 298 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 298 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  26.64 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  28.91 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  27.31 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  27.42 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  27.73 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  26.12 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  26.12 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.46 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  25.51 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  27.82 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  26.53 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.12 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  26.34 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5082  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5472  D-amino acid aminotransferase  27.57 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00355566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.91 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  30 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  27.24 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  26.47 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  23.41 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  23.41 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  32.81 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0069  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.62 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  23.41 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3086  D-amino acid aminotransferase  24.21 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  hitchhiker  0.00000000000000346975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  30.59 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.29 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  30.45 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2100  D-amino acid aminotransferase  23.02 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0135621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  30.83 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  23.02 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.29 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.29 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0079  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.29 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128474 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0070  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.29 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  30.83 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  29.69 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  27.6 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  32.91 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0078  4-amino-4-deoxychorismate lyase  23.02 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.199927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5238  4-amino-4-deoxychorismate lyase  24.33 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127403 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  27.44 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  27.44 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  27.17 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1655  D-amino acid aminotransferase  23.41 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  26.34 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  26.34 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  33.21 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  27.44 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  23.81 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  30.17 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>