More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5028 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5028  aminotransferase class IV  100 
 
 		 281 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37740  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.09 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.341981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1639  4-amino-4-deoxychorismate lyase  49.3 
 
 		 293 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6835  aminotransferase class IV  49.46 
 
 		 280 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5108  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.9 
 
 		 293 aa  221  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3637  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.7 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4535  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.95 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4622  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.95 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4918  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.95 
 
 		 292 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3850  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.86 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3571  aminotransferase class IV  48.07 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.210184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0953  aminotransferase class IV  46.07 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10827  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.24 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0391941 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5707  aminotransferase class IV  41.45 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4082  4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.79 
 
 		 289 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03810  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.21 
 
 		 299 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18900  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  45.1 
 
 		 333 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0374  aminotransferase class IV  36.64 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0311  aminotransferase, class IV  37.45 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  28.78 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  29.14 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  31.84 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.46 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  35.85 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.04 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  30.82 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  29.59 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6148  branched chain amino acid aminotransferase  31.56 
 
 		 276 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.2 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3389  aminotransferase, class IV  38.87 
 
 		 289 aa  95.9  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 299 aa  95.5  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  28.95 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  26.98 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  32.95 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  27.82 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  28.62 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.17 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  26.79 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  27.07 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  30.77 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3559  aminotransferase class IV  29.04 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.089993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  27.21 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  27.11 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  32.39 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  27.92 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  25.46 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  27.14 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0188  aminotransferase class IV  35.48 
 
 		 276 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  27.24 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  35.29 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  30.22 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  34.35 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  28.79 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  29.26 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2096  aminotransferase class IV  29.75 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0822851  normal  0.115441 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  34.35 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1405  aminotransferase class IV  26.89 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  24.45 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2868  aminotransferase class IV  26.52 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  26.06 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  26.94 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  25.75 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  26.67 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  29.44 
 
 		 741 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  29.75 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  25.18 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  28.52 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  23.83 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  32.88 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  32.46 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  26.81 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1614  D-amino acid aminotransferase  26.2 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  24.16 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  31 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  32.6 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>