More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1636 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1636  aminotransferase class IV  100 
 
 
283 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4377  aminotransferase class IV  64.66 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.505275  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3905  aminotransferase class IV  62.19 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0129654  normal  0.244879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4274  aminotransferase class IV  62.19 
 
 
285 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0051  aminotransferase class IV  60.61 
 
 
287 aa  264  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  51.99 
 
 
280 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0051  aminotransferase class IV  61.29 
 
 
279 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1139  aminotransferase class IV  49.48 
 
 
288 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.092565  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1562  aminotransferase class IV  40.29 
 
 
282 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.41201  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1897  aminotransferase class IV  42.97 
 
 
269 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0193132 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  35.52 
 
 
287 aa  145  6e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  35.14 
 
 
281 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  36.84 
 
 
298 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  45.19 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4200  aminotransferase class IV  49.22 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108763  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0760  aminotransferase, class IV  44.09 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1335  branched-chain amino acid aminotransferase  37.74 
 
 
264 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0319918  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2898  aminotransferase, class IV  40.3 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.051905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0412  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.97 
 
 
266 aa  128  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  42.91 
 
 
288 aa  126  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  32.85 
 
 
300 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  31.88 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1977  aminotransferase class IV  38.76 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.27 
 
 
271 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  33.96 
 
 
289 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  31.27 
 
 
271 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  31.27 
 
 
271 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  33.7 
 
 
297 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  32.25 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  33.06 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  32.98 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  31.64 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  31.01 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  32.72 
 
 
292 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  35.74 
 
 
298 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  32.26 
 
 
287 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  31.2 
 
 
291 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  30.43 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 
297 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
292 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
269 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0461  aminotransferase class IV  32.85 
 
 
311 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.893728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  34.15 
 
 
285 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  32.7 
 
 
291 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  29.97 
 
 
299 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  34.84 
 
 
288 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2046  aminotransferase class IV  33.45 
 
 
274 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0165127  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.47 
 
 
286 aa  105  7e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  32.33 
 
 
293 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  33.56 
 
 
307 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  31.06 
 
 
293 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  34.46 
 
 
307 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  31.4 
 
 
292 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.09 
 
 
277 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  35.22 
 
 
278 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  29.62 
 
 
292 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  33.21 
 
 
285 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  30.07 
 
 
290 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  32.24 
 
 
273 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  34.36 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1875  aminotransferase class IV  33.71 
 
 
283 aa  99.4  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  29.93 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  28.36 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  29.86 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16800  branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.65 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.039827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  28.77 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  29.89 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5918  aminotransferase class IV  35.43 
 
 
261 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  28.32 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  31.48 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  33.56 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  29.37 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  27.63 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  29.88 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  27.54 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  31.62 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0976  branched-chain amino acid aminotransferase family protein  34.16 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1780  aminotransferase class IV  36.57 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.14 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>