More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1662 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1662  aminotransferase, class IV  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2197  4-amino-4-deoxychorismate lyase  50.75 
 
 
271 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25710  4-amino-4-deoxychorismate lyase  50.75 
 
 
271 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0077515  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1998  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.04 
 
 
276 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1631  4-amino-4-deoxychorismate lyase  52.29 
 
 
271 aa  259  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3829  4-amino-4-deoxychorismate lyase  49.03 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0203451  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0004  aminotransferase, class IV  50.76 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000202983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1650  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.74 
 
 
271 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159709  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14950  4-amino-4-deoxychorismate lyase  49.44 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1528  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.74 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1917  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.12 
 
 
271 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307364  unclonable  0.000000254306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1418  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  48.9 
 
 
285 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.711679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3797  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.74 
 
 
271 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.172255  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1493  4-amino-4-deoxychorismate lyase  47.37 
 
 
271 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1831  4-amino-4-deoxychorismate lyase  46.24 
 
 
270 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4154  4-amino-4-deoxychorismate lyase  48.28 
 
 
271 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0929284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1502  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  42.26 
 
 
271 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0156373  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1274  4-amino-4-deoxychorismate lyase  43.3 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131481  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1577  aminotransferase, class IV  39.56 
 
 
277 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1475  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.47 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000862113  hitchhiker  0.00000000000021335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1297  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.38 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0225014  hitchhiker  1.45704e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02905  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
271 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002999  aminodeoxychorismate lyase  39.1 
 
 
271 aa  189  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0085011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1988  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.38 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000218178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2171  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.38 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  decreased coverage  0.000000000000025967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1217  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  188  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1312  4-amino-4-deoxychorismate lyase  41.38 
 
 
269 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.614636  hitchhiker  0.0000000000000833328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01092  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000953076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2228  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000140571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2505  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0018668  unclonable  0.0000000105414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01100  hypothetical protein  39.1 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000707213  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1218  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2551  aminodeoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2031  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.1 
 
 
269 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000010849  hitchhiker  0.00000935135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1604  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  41.46 
 
 
271 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0300662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2119  aminotransferase, class IV  37.97 
 
 
271 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00194364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2243  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.4 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000604374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2615  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.17 
 
 
269 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1545  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  40.74 
 
 
268 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.185803  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2216  aminotransferase, class IV  34.57 
 
 
269 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1764  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.8 
 
 
269 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1092  aminotransferase, class IV  37.78 
 
 
278 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1980  aminodeoxychorismate lyase  36.94 
 
 
271 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0416035  hitchhiker  0.00481294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1734  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.43 
 
 
269 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0256698  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2500  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.1 
 
 
265 aa  174  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00140105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1659  aminodeoxychorismate lyase apoprotein  36.43 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0501758  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1890  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  0.0459929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2454  aminotransferase class IV  34.94 
 
 
269 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00581034  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1909  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.06 
 
 
265 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  decreased coverage  0.000000690882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2574  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 
269 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.0405986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2461  aminotransferase, class IV  34.57 
 
 
269 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000415666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2242  aminotransferase, class IV  39.15 
 
 
277 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3495  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.39 
 
 
268 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000429214  hitchhiker  0.00824664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1689  4-amino-4-deoxychorismate lyase  40.39 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00992906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1626  4-amino-4-deoxychorismate lyase  36.11 
 
 
267 aa  163  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1611  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.92 
 
 
271 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2804  4-amino-4-deoxychorismate lyase  37.88 
 
 
265 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00411818  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2053  aminotransferase, class IV  38.02 
 
 
294 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1581  4-amino-4-deoxychorismate lyase  39.61 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1604  4-amino-4-deoxychorismate lyase  34.35 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2300  4-amino-4-deoxychorismate lyase  38.11 
 
 
268 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.187606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2269  aminotransferase class IV  36.36 
 
 
275 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.4966  normal  0.194503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2650  aminotransferase, class IV  35.45 
 
 
271 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23684 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1590  4-amino-4-deoxychorismate lyase  35.69 
 
 
267 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0229807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 
296 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1911  4-amino-4-deoxychorismate lyase, putative  38.26 
 
 
277 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.129492  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1586  aminodeoxychorismate lyase  38.26 
 
 
277 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0753996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1864  aminodeoxychorismate lyase  39.76 
 
 
272 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.358986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0716  aminotransferase, class IV  33.09 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0327665  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02332  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.58 
 
 
282 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1921  aminodeoxychorismate lyase  32.52 
 
 
300 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1255  aminodeoxychorismate lyase  36.19 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489867  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1545  aminotransferase class IV  36.33 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0432  4-amino-4-deoxychorismate lyase  31.75 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.217429  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  32.03 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  28.26 
 
 
293 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1920  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2109  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  33.33 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4442  aminotransferase class IV  32.49 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  31.68 
 
 
300 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.51 
 
 
297 aa  109  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 
292 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1654  branched-chain amino acid aminotransferase  29.54 
 
 
287 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 
288 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.45 
 
 
287 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1364  Aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 
307 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  30.52 
 
 
286 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
287 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  30.08 
 
 
287 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2972  aminotransferase class IV  32.64 
 
 
280 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  30.11 
 
 
286 aa  106  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0525  putative branched-chain amino acid aminotransferase  29.18 
 
 
281 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  29.34 
 
 
295 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.89 
 
 
293 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  28.57 
 
 
290 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  27.8 
 
 
292 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.94 
 
 
298 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  31.18 
 
 
297 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  28.94 
 
 
298 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  28.94 
 
 
298 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>